Coeficiente de determinação, redes booleanas probabilísticas e regulação gênica

• Processo: 04/01143-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2004
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2006
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
• Pesquisador responsável: Ronaldo Fumio Hashimoto
• Beneficiário: Ronaldo Fumio Hashimoto
• Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Regulação da expressão gênica Expressão gênica Predição de genes Coeficiente de determinação Redes booleanas probabilísticas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Coeficiente De Determinacao | Rede De Regulacao Genica | Redes Booleanas

Resumo

A tecnologia de "microarrays" tem se mostrado como uma importante ferramenta para a pesquisa genética envolvendo uma grande quantidade de genes. Um problema chave na análise de expressão de genes, a partir de dados provenientes de "microarrays", envolve a predição da expressão de um gene alvo em termos da expressão de outros genes preditores. O coeficiente de determinação (CoD) tem sido usado para medir a qualidade de tais predições. Além disso, recentemente, um novo modelo foi proposto na direção de fornecer uma visão integrada de como os genes se interagem: Rede Booleana Probabilística (PBN). Este projeto tem como interesse estudar problemas relacionados com CoDs e com PBNs. (AU)