Ambiente de bioinformática para análises de dados genômicos

• Processo: 06/55188-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2006
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Carlos Norberto Fischer
• Beneficiário: Carlos Norberto Fischer
• Instituição Sede: Instituto de Geociências e Ciências Exatas (IGCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Análise de dados Marcador molecular Polimorfismo genético Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ambiente Computacional | Bioinformatica | Dados Genomicos | Marcadores Moleculares

Resumo

O projeto geral visa desenvolver um ambiente computacional que integre sistemas e aplicativos que serão usados como ferramentas auxiliares em processos de análises de dados genômicos. Em especial, esta proposta tem por objetivo desenvolver e integrar ferramentas de Bioinformática voltadas para a (pré-)análise de alguns marcadores moleculares e polimorfismos, a saber, Elementos Transponiveis, Microssatélites e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), identificados em bancos oennminns Este ambiente deverá tornar automatizadas várias das tarefas envolvidas nestes tipos de análises. Dentre os sistemas e ferramentas a serem integrados ao Ambiente de Bioinformática estarão os desenvolvidos pelo Grupo de Bioinformática de Rio Claro (GBIRC), da UNESP, e outros aplicativos de domínio público. Estes serviços de Bioinformática estarão disponibilizados na web aos laboratórios e pesquisadores associados ao GBIRC. (AU)