Analise comparativa de genomas para estudo de regulacao transcripcional no desenvolvimento renal por pax-2 e gata-3.

• Processo: 06/57169-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2007
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2010
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Júlio César Martins Monte
• Beneficiário: Júlio César Martins Monte
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Organogênese
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genoma Comparativo | Impressao Filogenetica | Organogenese | Regulacao Transcripcional

Resumo

Isquemia renal constitui a principal causa de insuficiência renal aguda (IRA). Sabe-se que a restauração da integridade anatômica e funcional dos rins após lesão aguda é acompanhada pela ativação do programa genético expresso durante a embriogênese renal. Nas fases mais precoces, os fatores de transcrição exercem papel fundamental. Outras proteínas também são importantes, como as envolvidas em vias de sinalização Wnt, e fatores de crescimento, FGF, IGF, HGF e TGF(3. O objetivo do nosso trabalho é determinar os mecanismos de regulação transcripcional envolvidos durante o desenvolvimento renal. Selecionamos 10,000 pb franqueando os seguintes genes envolvidos na embriogênese renal: 1. Fatores de transcrição: PAX-2/8, GATA-3, AP-2 alfa, WT-1, PEA 3 e PBX-1. 2. Fatores de crescimento: Gndf, HGF, EGF, TGFbeta, BMP 4.3. Outros: WNT 4, GLYPICAN 3, HEPARAN SULFATO(HS2ST). Todos esses genes em humanos apresentam homólogos em camundongo (genes ortólogos). Essas seqüências de 10 kb em humanos e camundongos foram alinhadas (entre dois homólogos). As similaridades encontradas são chamadas impressões filogenéticas e constituem regiões com funcionalidade, visto que estão conservadas ao longo do tempo evolucionário que separa homens de camundongos (~60 milhões de anos), sendo prováveis sítios regulatórios da expressão desses genes. Nossa análise computacional demonstrou de forma consistente a presença de múltiplos sítios de ligação para dois fatores de transcrição: PAX-2 e GATA-3 utilizando a metodologia descrita (impressão filogenética) em todos os genes estudados (citados acima). Esses resultados teóricos do nosso grupo anteciparam os resultados experimentais publicados recentemente por Grote e cols. (Development 2006, 133(1):53-61) demonstrando associação de PAX-2 e GATA-3 na ontogenia renal. Assim, formulamos a hipótese de que esses dois fatores de transcrição estejam envolvidos na regulação de inúmeros genes durante o desenvolvimento renal. Esse projeto tem como objetivo a confirmação experimental dos nossos achados teóricos. (AU)