Estudo do efeito da metilacao do dna sobre a regulacao da transcricao de uma nova classe de rnas antisenso intronicos nao-codificantes.

• Processo: 07/53172-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2007
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2010
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Eduardo Moraes Rego Reis
• Beneficiário: Eduardo Moraes Rego Reis
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Metilação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Metilacao | Microarrays De Dna | Rnas Intronicos | Rnas Nao-Codificantes

Resumo

Nosso grupo tem caracterizado uma nova classe de RNAs, composta por transcritos intrônicos longos, expressos com orientação antisenso em relação ao mRNA codificante para proteína correspondente, e que possivelmente tem um papel importante na regulação da expressão gênica em situações normais e patológicas. Nesse projeto pretendemos utilizar linhagens celulares tratadas com o agente desmetilante 5-AZA em experimentos de hibridização com microarrays de expressão, experimentos de imunoprecipitação de citosinas metiladas seguido de hibridização com chips contendo ilhas CpG (ChIP-chip), e ensaios de expressão utilizando genes repórteres. Esse conjunto de experimentos permitirá identificar e caracterizar funcionalmente possíveis regiões promotoras com evidência de metilação e confirmar seu envolvimento na regulação da transcrição de ncRNAs intrônicos, permitindo assim avançar o conhecimento a cerca das possíveis funções biológicas dessa nova classe de RNAs. (AU)