Genoma do Schistosoma (cDNA Coordinator and Sequencing Center)

• Processo: 01/04129-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2004
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Emmanuel Dias-Neto
• Beneficiário: Emmanuel Dias-Neto
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genomas Schistosoma mansoni Transcrição genética Análise de sequência de DNA Genoma Schistosoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Est | Genoma | Orestes | Pcr De Baixa Estringenica | Schistosoma Mansoni | Transcriptoma

Resumo

We propose here to sequence in the next 18 months 120,000 EST clones generated by the ORESTES low-stringency RT-PCR amplification technique (Dias-Neto et al., PNAS U.S.A. 97: 3491-3496, 2000) using Schistosoma mansoni mRNA. We expect to generate 40 to 50 million bases of S. mansoni cDNA, which might represent on average an estimated 1 to 1.5 fold coverage of the parasite transcriptome. Different stages in the life cycle of the parasite will be studied. We expect to collect approximately 20,000 ESTs from each of the following 6 stages: cercariae, miracidium, adult worms (male/female), adult worms "resistant" to praziquantel (the drug presently used for treatment in humans), eggs and 7-day circulating schistosomula. (AU)