Laboratório associado de bioinformática no Programa Humano do Câncer

• Processo: 00/08723-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2000
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2002
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biologia Geral
• Acordo de Cooperação: Instituto Ludwig
• Pesquisador responsável: Arthur Gruber
• Beneficiário: Arthur Gruber
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Laboratórios Genoma Humano do Câncer
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Biologia Computacional | Bioquimica

Resumo

O Projeto Humano do Câncer é uma iniciativa conjunta da FAPESP e do Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer para a descoberta de genes humanos e compilação de regiões codificadoras humanas baseado em um novo conceito para o sequenciamento em larga escala de fases abertas de leitura (ORFs). O projeto consiste inteiramente no sequenciamento e análise de fragmentos curtos de cDNA gerados preferencialmente a partir de porções centrais de genes expressos humanos. Os fragmentos, denominados ORESTES, são gerados utilizando-se uma estratégia desenvolvida e patenteada pelo Instituto Ludwig. O projeto pretende montar os dados obtidos em conjunto com os dados existentes no Genbank e Unigene, resultando em ORFs anotadas potencialmente completas. Para a fase de análise dos dados foi montada uma rede de 10 laboratórios de Bioinformática associados ao laboratório de Bioinformática do Instituto Ludwig de Pesquisa contra o Câncer. O maior objetivo dessa rede é o de explorar detalhadamente essas sequências obtidas no Genoma Câncer. Além disso, pretende-se prover uma oportunidade de treinamento em biologia computacional para estudantes de graduação e pós-graduação. (AU)