Programa Genoma Xanthomonas Axonopodis pv citri. - laboratório de sequenciamento

• Processo: 99/06746-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 1999
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2002
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Regina Maria Barretto Cicarelli
• Beneficiário: Regina Maria Barretto Cicarelli
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCFAR). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 00/04179-5 - Projeto Genoma: Xanthomonas axonopodis pv citri - laboratório de sequenciamento, BP.TT; 99/08872-8 - Projeto Genoma Xanthomonas axonopodis pv. citri - laboratório de sequenciamento, BP.TT
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA Xanthomonas Genoma Xanthomonas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Canker | Cosmids | Dna Sequencing | Xanthomonas

Resumo

Seqüenciar clones obtidos de cosmídios e de palsmídios contendo DNA de Xanthomonas. Serão utilizadas as seqüências terminais para gerar bibliotecas que permitam, a posteriori, identificar os vários gaps que ainda permaneçam no mapa genômico. A estratégia de sequenciamento envolverá, portanto, dois estágios: o primeiro deles que possibilitará a obtenção das seqüências terminais dos clones e o segundo, que promoverá o sequenciamento completo do genoma, utilizando cerca de 200 clones do primeiro estágio. Pretende-se que o laboratório possa ser capaz de seqüenciar 250 mil bases ou pelo menos seis (6) cosmídios completos. Esta é a terceira vez que submetemos um projeto genoma à FAPESP, porque em nosso entender a região de Araraquara, SP é uma região de destaque em termos de produção de laranja (e também de cana-de-açúcar) e possui pessoal científico qualificado para assumir um projeto dessa natureza. Nossa intenção é simplesmente trabalhar muito no projeto, baseadas nos conhecimentos que adquirimos em biologia molecular ao longo dos anos. Também é nosso objetivo colaborar na formação de recursos humanos qualificados na área biotecnológica nesta região. Para isso, contamos com vários estudantes-estagiários que também nos poderão ajudar tecnicamente, qualificando-se gradativamente para o futuro mercado de trabalho. (AU)