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Programa Genoma Xanthomonas Axonopodis pv citri. - laboratório de sequenciamento

Processo: 99/06673-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
Vigência: 01 de setembro de 1999 - 31 de julho de 2002
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Elisabete José Vicente
Beneficiário:Elisabete José Vicente
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):99/09569-7 - Genoma Xanthomonas citri, BP.TT
99/09570-5 - Genoma Xanthomonas citri, BP.TT
Assunto(s):Genoma Xanthomonas 

Resumo

O Projeto Genoma FAPESP surgiu da necessidade da ampliação nacional de pesquisa numa área ainda deficiente no Brasil, a biologia molecular relacionada a processos de seqüenciamento em grande escala. Isto tem permitido ao país uma capacitação de pessoal em áreas que vão do simples processo de sequenciamento automatizado, como também na análise das sequências gerada em si, através de compreensão das ferramentas de Bioinformática. No Brasil e em todo o mundo, a bactéria Xanthomonas axonopodis pv citri causa o cancro cítrico em plantas cítricas, com um impacto econômico anual estimado em 10 milhões de dólares. Muitas outras espécies relacionadas a Xanthomonas atacam outras plantas economicamente importantes, como o arroz, o algodão, o feijão e a uva. O conhecimento da sequência completa do genoma de Xanthomonas anapodis pv citri será, portanto, de enorme valor potencial para a economia interna do país e para numerosos setores da agricultura em vários países do mundo. Os dados do genoma gerados por este projeto serão um recurso importante no esforço de compreender a biologia geral de Xanthomonas e a variedade de interações entre Xanthomonas e outros hospedeiros, de impacto econômico. Além disso, esta sequência genômica será de formidável uso na pesquisa básica dentro das bases moleculares das interações planta-patógeno, pois devido à próxima relação de X citri com X campestris pv campestris, esta última está sendo atualmente usada como um patógeno modelo em estudos com Arabidopsis thaliana, que é um organismo modelo para o estudo de genética de plantas e cujo genoma estará completado em pouco tempo. Finalmente, X axoponopodis apresenta uma relação próxima com a bactéria Xylella fastidiosa, mas tem um genoma, aproximadamente, duas vezes maior. É estimado que o genoma de X axonopodis pv citri tem aproximadamente 5 Mpb. A disponibilidade dos dois genomas permitir-nos-á comparar a composição genética das duas espécies e determinar suas similaridades e diferenças importantes, que determinam seus metabolismos sem distinções, ciclos de vida e interações com seus hospedeiros comuns. Esta comparação permitirá não só uma análise da relação evolutiva das duas bactérias, como também possibilitará a identificação de genes que podem estar relacionados ao ambiente em que vivem, uma de vida livre (Xaxonopodis) e outra limitada ao xilema da planta (Xylella fastidiosa). (AU)

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