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SUCEST - data mining

Processo: 99/02840-7
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
Data de Início da vigência: 01 de junho de 1999
Data de Término da vigência: 31 de maio de 2002
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Antonio Vargas de Oliveira Figueira
Beneficiário:Antonio Vargas de Oliveira Figueira
Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Cana-de-açúcar  Genomas  Análise de sequência de DNA  Saccharum  Genoma Cana-de-Açúcar - SucEST 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cana-De-Acucar | Est | Genoma | Saccharum | Sequenciamento

Resumo

O objetivo do projeto consiste em sequenciar em grande escala, os genes expressos em vários tipos de tecidos e/ou sob diversas condições de cana-de-açúcar, de forma a identificar todos os genes expressos e responsáveis pelas diversas funções da planta. Serão recebidas sequências de cDNA, obtidas em um laboratório central, responsável pela construção das bibliotecas de DNA complementar dos vários tecidos elou sob vários tratamentos, e estas serão sequenciadas. O nosso laboratório tem interesse em sequenciar 22.000 sequências em 4 anos, sendo 4.000 no primeiro e 6.000 nos 3 anos subsequentes. As sequências obtidas serão depositadas num banco de dados e analisadas por outros grupos de forma a identificar a função das várias mensagens expressas. (AU)

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