SUCEST - data mining

• Processo: 99/02840-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 1999
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2002
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Antonio Vargas de Oliveira Figueira
• Beneficiário: Antonio Vargas de Oliveira Figueira
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Genomas Análise de sequência de DNA Saccharum Genoma Cana-de-Açúcar - SucEST
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana-De-Acucar | Est | Genoma | Saccharum | Sequenciamento

Resumo

O objetivo do projeto consiste em sequenciar em grande escala, os genes expressos em vários tipos de tecidos e/ou sob diversas condições de cana-de-açúcar, de forma a identificar todos os genes expressos e responsáveis pelas diversas funções da planta. Serão recebidas sequências de cDNA, obtidas em um laboratório central, responsável pela construção das bibliotecas de DNA complementar dos vários tecidos elou sob vários tratamentos, e estas serão sequenciadas. O nosso laboratório tem interesse em sequenciar 22.000 sequências em 4 anos, sendo 4.000 no primeiro e 6.000 nos 3 anos subsequentes. As sequências obtidas serão depositadas num banco de dados e analisadas por outros grupos de forma a identificar a função das várias mensagens expressas. (AU)