Genômica funcional: núcleo de análise de expressão gênica

• Processo: 04/08859-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2005
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2007
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Angela Kaysel Cruz
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Expressão gênica Genômica funcional Genômica comparativa Equipamentos e provisões
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Expressao Genica | Genomica Comparativa | Genomica Funcional
• Página web do EMU: Página do Equipamento Multiusuário não informada
• Tipo de equipamento: Tipo de Equipamento Multiusuário não informado
• Fabricante: Fabricante não informado
• Modelo: Modelo não informado

Resumo

Os objetivos são colaborar com o Projeto Genoma Leishmania, uma iniciativa internacional, que está completando o seqüenciamento do genoma de Leishmania y major. Esta colaboração ocorre em várias instâncias: desde a colaboração com o seqüenciamento e anotação do cromossomo 2 de L.major, a condução de um projeto piloto de sequenciamento do genoma de L.braziliensis através da geração de GSSs até estudos específicos sobre aspectos organizacionais e funcionais do genoma de Leishmania. As diferenças observadas no conteúdo dos genomas das duas espécies são notáveis e tornou-se nosso objetivo entender mais x compreensivamente o significado biológico dessas diferenças. Estamos estabelecendo uma estratégia de nocaute sistemático de genes do parasita através do uso de transposons e delineando as condições ideais para geração sistemática de armadilha de genes empregando a mesma ferramenta. Estas abordagens vêm sendo usadas também como ferramenta importante para as análises de genômica comparativa que vimos conduzindo. Avanços na compreensão das diferenças entre os genomas de L.major e L.braziliensis dependem em grande parte de estratégias globais de análises de perfil de expressão gênica, nos vários níveis: de conteúdo de genoma, e perfis de transcrição e tradução. Estudamos a organização das regiões teloméricas dos cromossomos do parasita e aspectos funcionais relacionados a essas regiões. Transcritos de L.major candidatos a desempenhar função como RNA não codificadores foram encontrados e vêm sendo investigados. (AU)