Diagnóstico molecular e diversidade genética de Xanthomonas axonopodis pv. citri, agente da cancrose A dos citros

• Processo: 04/04381-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2004
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2006
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Helvecio Della Coletta Filho
• Beneficiário: Helvecio Della Coletta Filho
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Fitopatógenos Xanthomonas axonopodis Cancro (doença de planta) Marcador molecular Diversidade genética Reação em cadeia por polimerase (PCR) Genomas Variação genética em plantas Citricultura Citrus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Citros | Diagnostico Molecular | Doenca Quarentenaria | Fitopatogeno | Marcadores Moleculares | Variabilidade Genetica

Resumo

A bactéria Xanthomonas axonopodis pv citri (Xac) patovar A, causadora do cancro cítrico, está presente no Brasil desde o final da década de 50 e desde então vem causando grandes prejuízos à citricultura. Estudos enfocando a patologia, diversidade genética e métodos de diagnósticos para esta bactéria já foram realizados, quase todos baseados em métodos de reduzido poder de detecção. No entanto um método de diagnóstico rápido e preciso, baseado na reação em cadeia da polimerase (PCR), é ainda objeto de estudos, uma vez que iniciadores suficientemente Xac-específicos ainda não são conhecidos. Além do mais, há carência de informações sobre a diversidade genética deste patógeno. Desse modo, os objetivos principais deste trabalho são: 1. desenvolver primers Xac-específicos e um sistema de diagnóstico que possa ser utilizado rotineiramente na detecção desta bactéria através da PCR; 2. estabelecer marcadores moleculares baseados em seqüências repetitivas (SSR) para estudos de diversidade genética da bactéria. Para o desenvolvimento de iniciadores Xac-específicos serão utilizadas as informações dos projetos genomas das x.a. pv. citri e X. campestris, onde regiões diferenciais e potencialmente específicas foram selecionadas. Para estudos de diversidade genética, regiões com DNA repetitivo presente no genoma da Xac serão selecionadas através de um programa computacional (Benson, 1999) e iniciadores serão desenhados nas extremidades destas regiões. Iniciadores potencialmente polimórficos serão utilizados nos estudos de diversidade genética de isolados de Xac. (AU)