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Análises filogenéticas com dados moleculares: implementação de infra-estrutura computacional básica no Centro de Biologia Marinha da USP

Processo: 06/60327-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa Primeiros Projetos
Vigência: 01 de maio de 2007 - 30 de abril de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Zoologia
Convênio/Acordo: CNPq - Programa Primeiros Projetos
Pesquisador responsável:Alberto Lindner
Beneficiário:Alberto Lindner
Instituição Sede: Centro de Biologia Marinha (CEBIMAR). Universidade de São Paulo (USP). São Sebastião , SP, Brasil
Assunto(s):Filogenia  Evolução molecular  DNA  Hidrozoários 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Anthomedusae | Dna | Evolucao | Filogenia Molecular | Hydrozoa | Infra-Estrutura

Resumo

A crescente utilização de dados moleculares em estudos de evolução e biodiversidade tem sido possível, em grande parte, devido aos avanços na área de informática. Somente na área de filogenética, por exemplo, mais de 250 programas ("softwares") de análise são atualmente disponíveis. Entretanto, a infraestrutura de microcomputadores ("hardware") necessária para executar estes programas e análises nem sempre é disponível nas instituições de pesquisa. Uma destas instituições é o Centro de Biologia Marinha (CEBIMar) da Universidade de São Paulo, onde desenvolvo projeto de pós- doutorado em filogenia molecular de cnidários (FAPESP proc. n° 2006/02960-8). O objetivo da presente proposta é implementar um laboratório de análises filogenéticas no CEBIMar-USP. A infraestrutura solicitada inclui microcomputadores e equipamentos periféricos, e beneficiará diretamente o meu projeto de pós-doutorado. O laboratório estará também disponível para outros pesquisadores que necessitem de infraestrutura em informática para a execução de análises filogenéticas. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE SOUZA, JULIA N.; NUNES, FLAVIA L. D.; ZILBERBERG, CARLA; SANCHEZ, JUAN A.; MIGOTTO, ALVARO E.; HOEKSEMA, BERT W.; SERRANO, XAYMARA M.; BAKER, ANDREW C.; LINDNER, ALBERTO. Contrasting patterns of connectivity among endemic and widespread fire coral species (Millepora spp.) in the tropical Southwestern Atlantic. CORAL REEFS, v. 36, n. 3, p. 701-716, . (06/60327-0, 06/05821-9, 06/02960-8)
GNECCO, MARIANA; NUNES, FLAVIA L. D.; GONZALEZ-ZAPATA, FANNY L.; DUENAS, LUISA F.; ZILBERBERG, CARLA; LINDNER, ALBERTO; SANCHEZ, JUAN A.. Remarkable population structure in the tropical Atlantic lace corals Stylaster roseus (Pallas, 1766) and Stylaster blatteus (Boschma, 1961). CORAL REEFS, v. 42, n. 1, p. 14-pg., . (06/05821-9, 06/60327-0, 06/02960-8)

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