Determinação da biodiversidade e atividade de bactérias da mucosa intestinal de portadores de retocolite ulcerativa e Doença de Crohn através da análise da região V6 do 16SrDNA

• Processo: 12/18469-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Josias Rodrigues
• Beneficiário: Josias Rodrigues
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Gastroenteropatias Proctocolite Doença de Crohn Mucosa intestinal Biologia molecular Infecções bacterianas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bacteria | Crohn | doença | intestino | retocolite | Rna | Bacteriologia Médica

Resumo

Retocolite ulcerativa (RU) e doença de Crohn (DC) são variantes clínicas das doenças inflamatórias intestinais (DII) idiopáticas, que se manifestam como lesões difusas na mucosa do cólon, no caso da RU e focais em qualquer parte do aparelho digestório, no caso da DC. Estas lesões resultam da resposta anômala do sistema imune a antígenos bacterianos, tendo por base fatores genéticos e ambientais. Entre estes, se inclui a dieta, que tem influência direta na composição de espécies da microbiota intestinal. Vários estudos têm demostrado a ocorrência de disbiose no intestino de portadores de DII. Todavia, em alguns casos, as conclusões são limitadas pelo desconhecimento da maioria das espécies bacterianas intestinais. A aplicação de técnicas de Biologia Molecular tem contribuído para a identificação bacteriana. Uma das abordagens de identificação considera a análise comparativa de sequências de bases do 16SrDNA de amostras intestinais com sequências correspondentes disponíveis em bancos de dados de DNA. Neste projeto, através da análise da região V6 do 16SrDNA, pretendemos determinar a biodiversidade e atividade de bactérias da mucosa de portadores de DII (20 diagnosticados com DC e 20 com RU) e de controles (20 indivíduos). Para isto, amplicons da região V6 do 16SrDNA e cDNA do 16SrRNA de biópsias intestinais serão separados em eletroforese em gradiente de temperatura (TGGE) e os perfis obtidos, que representam as comunidades bacterianas presentes, serão analisados em função de variáveis tais como grupo de estudo (DC, RU ou controle), segmento intestinal, atividade da doença, dieta, etc. Posteriormente, amplicons destes DNAs serão submetidos ao pirosequenciamento, a fim de se determinar os grupos bacterianos detectados. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DA SILVA SANTOS, ANA CAROLINA; JENSEN, JOSE RICARDO; DE OLIVEIRA, SILVIO LUIS; RODRIGUES, JOSIAS. Gut dysbiosis in mice genetically selected for low antibody production. GUT PATHOGENS, v. 9, AUG 7 2017. (12/18469-2)