Molecular Simulation and the pDynamo Workshop - 2013

• Processo: 13/05466-8
• Modalidade de apoio: Auxílio Organização - Reunião Científica
• Data de Início da vigência: 21 de novembro de 2013
• Data de Término da vigência: 23 de novembro de 2013
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Guilherme Menegon Arantes
• Beneficiário: Guilherme Menegon Arantes
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Enzimologia Simulação de dinâmica molecular Química quântica Biofísica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biofísica Molecular | Enzimologia | estrutura e dinâmica de proteínas | Mm | potenciais híbridos QM | Química Quântica | simulação molecular | Bioquímica e biofísica computacionais

Resumo

Simulação computacional tem um papel crescente em bioquímica e biofísica molecular. Esta proposta apresenta um workshop da biblioteca para simulações moleculares pDynamo e um subsequente simpósio científico ``Molecular Simulation'' enfocando técnicas de simulação avançadas e resultados recentes, apresentados por pesquisadores de reconhecimento internacional.O workshop da biblioteca pDynamo foi realizado em quatro ocasiões no exterior desde 2007, contribuindo para formação de pesquisadores, pela ampliação da base de usuários e para discussão de novas implementações e avanços na biblioteca. A presença de vários grupos no Brasil que utilizam e desenvolvem modificações na biblioteca pDynamo, assim como a crescente presença de simulação computacional na ciência produzida no pais, indicam que a realização do workshop em São Paulo será bastante frutífera.Da mesma forma, o simpósio ``Molecular Simulation'' também já foi realizado em quatro edições no IQ-USP desde 2009. No ano passado, o simpósio contou com financiamento da FAPESP e também foi precedido por um workshop. O impacto destes simpósios é bastante relevante pois tornaram-se um fórum para troca de experiências e para o estabelecimento de colaborações.O público alvo do evento proposto é de estudantes de pós-graduação e de pesquisadores que já tenham alguma familiaridade com simulação molecular, mas sem necessariamente já terem usado a biblioteca pDynamo. O programa do evento apresenta um crescente de tópicos básicos até avançados, apontando as capacidades da biblioteca por exemplos, tutoriais e seções práticas. O simpósio subsequente apresentará resultados de pesquisa recentes ilustrando a fronteira da pesquisa em simulação molecular.Finalmente, o evento proposto será satélite ao Simpósio Brasileiro de Química Teórica, contribuindo assim, para sua divulgação e abrangência. (AU)