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Desenvolvimento de um banco de dados para gerenciamento do perfil molecular de cultivares comerciais, genitores e acessos selvagens de cana-de-açúcar

Processo: 13/22500-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Regular
Vigência: 01 de março de 2014 - 29 de fevereiro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:Luciana Rossini Pinto Machado da Silva
Beneficiário:Luciana Rossini Pinto Machado da Silva
Instituição-sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):15/12542-8 - Estabelecimento de perfis moleculares (fingerprint) de acessos selvagens de cana-de-açúcar do banco de germoplasma cana - IAC, BP.TT
Assunto(s):Melhoramento genético vegetal  Cana-de-açúcar  Marcador molecular  Genótipo  Germoplasma vegetal  Análise do polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados  Bioenergia 

Resumo

O gerenciamento eficiente do germoplasma de um Programa de Melhoramento é fundamental para o desenvolvimento de novas cultivares. No Brasil, os programas de melhoramento de cana-de-açúcar têm utilizado marcadores moleculares na caracterização do perfil molecular de seus genótipos, entretanto, não há um banco consolidado com o perfil molecular de cultivares de cana-de-açúcar, clones elites e acessos selvagens. O programa de melhoramento genético de cana-de-açúcar do Instituto Agronômico desenvolveu um software capaz de armazenar o perfil molecular de genótipos de cana-de-açúcar gerado por marcadores moleculares, e pelo perfil molecular, identificar um genótipo previamente armazenado no banco. Para a efetiva utilização e aplicação deste software é necessário estabelecer o perfil molecular de genótipos de interesse. O presente projeto tem como objetivo principal iniciar a construção de um banco com o perfil molecular de cultivares de cana-de-açúcar, acessos selvagens e clones elites utilizados como genitores em cruzamentos. Pretende-se também criar um banco de DNA genômico dos genótipos; identificar um conjunto de microssatélites com alto poder discriminatório; estimar a variabilidade genética entre e dentro dos grupos avaliados e desenvolver marcadores do tipo SCARs (sequence characterized amplified regions) derivados de AFLP (Amplified fragment length polymorphism) espécie específicos de S. spontaneum. O desenvolvimento de SCARs permitirá a rápida identificação de híbridos verdadeiros provenientes de cruzamentos envolvendo cultivares comerciais e acessos de S. spontaneum auxiliando os Programas de Introgressão Genética para Bioenergia. Destacamos que, até o presente momento, em se tratando de programas públicos de melhoramento, não existe, no Brasil, um banco de perfil molecular de tal natureza para a cana-de-açúcar. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
VIEIRA MANECHINI, JOAO RICARDO; DA COSTA, JULIANA BORGES; PEREIRA, BRUNA TURCATTO; CARLINI-GARCIA, LUCIANA APARECIDA; XAVIER, MAURO ALEXANDRE; DE ANDRADE LANDELL, MARCOS GUIMARAES; PINTO, LUCIANA ROSSINI. Unraveling the genetic structure of Brazilian commercial sugarcane cultivars through microsatellite markers. PLoS One, v. 13, n. 4 APR 23 2018. Citações Web of Science: 3.
NEUBER, ANA CAROLINE; CAMILO DOS SANTOS, FERNANDA RAQUEL; DA COSTA, JULIANA BORGES; VOLPIN, MAICON; XAVIER, MAURO ALEXANDRE; PERECIN, DILERMANDO; VILLAVICENCIO BURBANO, ROBERTO CARLOS; DE ANDRADE LANDELL, MARCOS GUIMARAES; PINTO, LUCIANA ROSSINI. Survey of the Bru1 gene for brown rust resistance in Brazilian local and basic sugarcane germplasm. PLANT BREEDING, v. 136, n. 2, p. 182-187, APR 2017. Citações Web of Science: 3.

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