Estudo da flexibilidade das proteínas NS3 e NS5 do dengue vírus (DENV) através de análise de modos normais e dinâmica molecular

• Processo: 14/02689-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2014
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2016
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Antonio Sergio Kimus Braz
• Beneficiário: Antonio Sergio Kimus Braz
• Instituição Sede: Centro de Ciências Naturais e Humanas (CCNH). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/03522-3 - Estudo da Flexibilidade das Proteínas NS3 e NS5 do Dengue Virus (DENV) através de Análise de Modos Normais e Dinâmica Molecular, BP.TT
• Assunto(s): Simulação de dinâmica molecular Modelagem molecular Vírus da dengue
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Denv | Dinâmica Molecular | Modelagem molecular | modos normais | Ns3 | Ns5 | Modelagem Molecular

Resumo

Estima-se que aproximadamente 300 milhões de pessoas anualmente sejam acometidas pela dengue no mundo. No Brasil, ela é uma das doenças que causa mais impacto na Saúde Pública. Entretanto, a despeito dos numerosos esforços e métodos empregados por diversos grupos de pesquisa, atualmente nem antivirais nem vacina aprovados estão disponíveis para o tratamento ou prevenção da dengue. Nesse sentido, há um crescente interesse internacional na caracterização de alvos de drogas contra a dengue. O genoma do DENV codifica uma poliproteína que é processada por uma protease dando origem a 3 proteínas estruturais (S) 7 não estruturais (NS). Duas delas, NS3 e NS5, são particularmente interessantes por participarem do complexo de replicação viral e serem determinantes de patogenicidade ao interagirem com dezenas de proteínas do hospedeiro. Dentre as proteínas alvo do hospedeiro destacam-se proteínas envolvidas na sinalização por interferon (STAT2 e TYK2) e proteínas envolvidas no trafico nuclear (KPNB1 e XPO1).O presente projeto deve fornecer informações sobre movimentos das proteínas virais NS3 e NS5 e as suas proteínas humanas alvo (STAT2, TYK 2, KPNB1 e XPO1). Procuramos por movimentos cujas principais características físicas são uma grande amplitude e uma baixa frequência. Esse tipo de movimento, normalmente está associado a mecanismos de regulação alostérica. Além disso, essas informações serão muito úteis em futuros trabalhos de Docking proteína x proteína e virtual screening para o desenvolvimento de novos inibidores alostéricos contra NS3 e NS5 para os diversos sorotipos do DENV. (AU)