Resumo
Durante a diferenciação celular, vários mecanismos bioquímicos são empregados pela célula para garantir que genes sejam expressos no momento e quantidade adequados, modulando corretamente as diversas vias envolvidas neste complexo processo. Um destes mecanismos controla quais mRNAs especificamente e em que taxa serão traduzidos pelos ribossomos e é conhecido como controle traducional da expressão gênica. Desde algum tempo se sabe que este mecanismo deve ser fundamental para o funcionamento celular, visto que a expressão proteica apresenta má correlação com a expressão de mRNA. Apesar disto, os diversos fatores que participam deste mecanismo, como ele opera e quais vias regula ainda são pouco compreendidos. Neste projeto pretendemos entender como a regulação traducional da expressão gênica contribui para a diferenciação neuronal de células tronco. Quais genes e vias são reguladas traducionalmente no processo de diferenciação e quais proteínas/miRNA participam desta regulação.Para chegar a estes objetivos, iremos comparar o níveis globais de expressão genica de cada mRNA celular (biblioteca de RNAseq) com o nível dos mRNAs correspondentes ligados aos ribossomos (biblioteca de Riboseq), em diferentes pontos da diferenciação neural. Buscaremos encontrar genes cuja expressão de mRNA não mude, mas que a fração ligada ao ribossomo seja alterada durante a diferenciação, por exemplo. A expressão de miRNAs e de proteínas ligantes de RNA serão comparadas entre os mesmos pontos de tempo para sugerir possíveis responsáveis pela regulação. Usaremos ensaios biológicos e bioinformática para determinar o impacto da regulação no processo de diferenciação. (AU)
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