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Impacto da regulação traducional na diferenciação neuronal

Processo: 14/21704-9
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
Vigência: 01 de setembro de 2015 - 31 de outubro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Mário Henrique Bengtson
Beneficiário:Mário Henrique Bengtson
Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Pesquisadores associados:André Fujita ; Katlin Brauer Massirer ; Roberto Hirochi Herai
Bolsa(s) vinculada(s):19/00154-4 - Impacto da regulação traducional na diferenciação neuronal, BP.TT
16/23120-0 - Identificação de fatores responsáveis pela regulação traducional na diferenciação neuronal, BP.DD
15/21433-8 - Identificação de vias moleculares reguladas traducionalmente na diferenciação neuronal, BP.DD
Assunto(s):Diferenciação celular  Ribossomos  RNA mensageiro  Expressão gênica  Análise de sequência de RNA 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:controle traducional | diferenciação celular | Ribosome profiling | RNAseq | Tradução | Controle traducional, diferenciação celular, biologia de sistemas

Resumo

Durante a diferenciação celular, vários mecanismos bioquímicos são empregados pela célula para garantir que genes sejam expressos no momento e quantidade adequados, modulando corretamente as diversas vias envolvidas neste complexo processo. Um destes mecanismos controla quais mRNAs especificamente e em que taxa serão traduzidos pelos ribossomos e é conhecido como controle traducional da expressão gênica. Desde algum tempo se sabe que este mecanismo deve ser fundamental para o funcionamento celular, visto que a expressão proteica apresenta má correlação com a expressão de mRNA. Apesar disto, os diversos fatores que participam deste mecanismo, como ele opera e quais vias regula ainda são pouco compreendidos. Neste projeto pretendemos entender como a regulação traducional da expressão gênica contribui para a diferenciação neuronal de células tronco. Quais genes e vias são reguladas traducionalmente no processo de diferenciação e quais proteínas/miRNA participam desta regulação.Para chegar a estes objetivos, iremos comparar o níveis globais de expressão genica de cada mRNA celular (biblioteca de RNAseq) com o nível dos mRNAs correspondentes ligados aos ribossomos (biblioteca de Riboseq), em diferentes pontos da diferenciação neural. Buscaremos encontrar genes cuja expressão de mRNA não mude, mas que a fração ligada ao ribossomo seja alterada durante a diferenciação, por exemplo. A expressão de miRNAs e de proteínas ligantes de RNA serão comparadas entre os mesmos pontos de tempo para sugerir possíveis responsáveis pela regulação. Usaremos ensaios biológicos e bioinformática para determinar o impacto da regulação no processo de diferenciação. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LINS, ERICO MORETO; OLIVEIRA, NATASSIA CRISTINA MARTINS; REIS, OSVALDO; FERRASA, ADRIANO; HERAI, ROBERTO; MUOTRI, ALYSSON R.; MASSIRER, KATLIN BRAUER; BENGTSON, MARIO HENRIQUE. Genome-wide translation control analysis of developing human neurons. MOLECULAR BRAIN, v. 15, n. 1, p. 15-pg., . (14/21704-9, 14/50897-0, 15/21433-8)
MIGITA, NATACHA AZUSSA; JOTTA, PATRICIA YOSHIOKA; DO NASCIMENTO, NATALIA PAIVA; VASCONCELOS, VICTOR SANDE; CENTODUCATTE, GABRIEL LOPES; MASSIRER, KATLIN BRAUER; DE AZEVEDO, AMILCAR CARDOSO; BRANDALISE, SILVIA REGINA; YUNES, JOSE ANDRES. Classification and genetics of pediatric B-other acute lymphoblastic leukemia by targeted RNA sequencing. BLOOD ADVANCES, v. 7, n. 13, p. 15-pg., . (14/21704-9, 14/50897-0)
MARTINS OLIVEIRA, NATASSIA CRISTINA; LINS, ERICO MORETO; MASSIRER, KATLIN BRAUER; BENGTSON, MARIO HENRIQUE. Translational Control during Mammalian Neocortex Development and Postembryonic Neuronal Function. SEMINARS IN CELL & DEVELOPMENTAL BIOLOGY, v. 114, n. SI, p. 36-46, . (15/21433-8, 14/21704-9)
SACHAMITR, PATTY; HO, JOLENE C.; CIAMPONI, FELIPE E.; BA-ALAWI, WAIL; COUTINHO, FIONA J.; GUILHAMON, PAUL; KUSHIDA, MICHELLE M.; CAVALLI, FLORENCE M. G.; LEE, LILIAN; RASTEGAR, NAGHMEH; et al. PRMT5 inhibition disrupts splicing and stemness in glioblastoma. NATURE COMMUNICATIONS, v. 12, n. 1, . (16/25521-1, 15/25134-5, 14/50897-0, 14/21704-9)

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