First insights on the retroelement Rex1 in the cytogenetics of frogs

• Processo: 15/22383-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2016
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Luciana Bolsoni Lourenço
• Beneficiário: Luciana Bolsoni Lourenço
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Citogenética Retroelementos Cromossomos Anura Physalaemus Publicações de divulgação científica Artigo científico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: anuros | cromossomo | retrotransposon | Citogenética

Resumo

Elementos transponíveis têm sido encontrados em genomas de anuros já sequenciados, mas estudos detalhados acerca desses elementos ainda não estão disponíveis. Neste trabalho, nós investigamos a ocorrência do elemento Rex1, que está amplamente distribuído em peixes, em anuros do gênero Physalaemus. Nós isolamos e caracterizamos sequências codificadoras de transcriptase reversa de elementos Rex1 de cinco espécies desse gênero.As sequências de aminoácidos presumidas a partir de sequências nucleotídicas nos permitiram identificar regiões correspondentes aos domínios 3-7 da RT. Algumas das sequências nucleotídicas isoladas de Physalaemus ephippifer e P. albonotatus tiveram deleções internas, sugerindo que esses elementos não sejam mais TEs ativos. Quando hibridadas em cromossomos metafásicos, as sondas Rex1 detectaram regiões heterocromáticas pericentroméricas do cromossomo 3 de P. ephippifer. Nenhum outro sítio desse cariótipo ou dos cariótipos de P. albonotatus, P. spiniger e P. albifrons foram detectados por essas sondas.Elementos Rex1 foram encontrados nos genomas de cinco espécies de Physalaemus, mas foram observados em clusters apenas no cariótipo de P. ephippifer, diferindo das observações feitas em peixes, em cujos cariótipos grandes sítios portadores de Rex1 são comumente encontrados. (AU)