Marcadores diagnósticos e prognósticos aplicáveis na prática clínica para pacientes com nódulos tireoidianos: validação de achados prévios e estudos funcionais

• Processo: 15/20748-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2018
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Anatomia Patológica e Patologia Clínica
• Pesquisador responsável: Silvia Regina Rogatto
• Beneficiário: Silvia Regina Rogatto
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FMB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Fabio Albuquerque Marchi ; Luiz Paulo Kowalski
• Assunto(s): Oncologia Neoplasias da glândula tireoide Biomarcadores tumorais Técnicas e procedimentos diagnósticos Biópsia por agulha fina Expressão gênica Metilação MicroRNAs
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Braf | Câncer de tireoide | diagnóstico | expressão gênica | metilação | microRNA | Oncologia

Resumo

Nódulos tireoidianos são comuns na população adulta, sendo detectados em 70% dos exames ultrassonográficos. Entretanto, métodos diagnósticos atuais apresentam limitações em distinguir lesões foliculares malignas das benignas, acarretando em um significativo número de cirurgias potencialmente evitáveis. Dessa forma, é de grande interesse o desenvolvimento de métodos moleculares diagnósticos e prognósticos aplicáveis na prática clínica para lesões da tireoide. Estudos prévios do grupo identificaram potenciais marcadores com base na análise global de transcritos e de metilação de DNA em variadas lesões malignas e benignas de tireoide obtidas de peças cirúrgicas. Com base nesses resultados, pretende-se testar prospectivamente o potencial destes candidatos para o diagnóstico de lesões tireoidianas diretamente em punções aspirativas por agulha fina (PAAF). Devido à alta frequência de mutações em BRAF encontrada nos casos de carcinoma papilíferos de tireoide (CPT), a avaliação dessa alteração será incorporada para aperfeiçoar o desempenho do teste baseado na análise de DNA. Em outro estudo prévio do grupo foi avaliado o perfil de metilação de DNA de amostras de CPT pareadas com o tecido normal adjacente, onde foram observados genes codificadores de miRNA diferencialmente metilados. O CPT é a neoplasia maligna tireoidiana mais frequente e, apesar de geralmente indolente, uma parcela dos pacientes apresenta doença agressiva, para os quais não restam opções terapêuticas eficazes. Dessa forma, pretendemos estudar funcionalmente o impacto da metilação e da expressão desses miRNAs em linhagens celulares de câncer de tireoide. Este projeto foi delineado em duas etapas distintas com os objetivos de (1) comprovar a aplicabilidade e o desempenho dos ensaios moleculares utilizando o fluxo de biópsias executadas no AC Camargo Cancer Center e (2) caracterizar as alterações epigenéticas envolvidas no controle da expressão de miRNAs e utilizar ensaios funcionais, os quais permitirão avançar no conhecimento dos CPT e levar a descoberta de novos alvos terapêuticos. (AU)

Publicações científicas

(8)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DIAS PAYAO ORTIZ, ISABELLA MARIA; BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; DOS REIS, MARIANA BISARRO; BELTRAMI, CAROLINE MORAES; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; KUASNE, HELLEN; DO CANTO, LUISA MATOS; HOMEM DE MELLO, JULIA BETTE; ABILDGAARD, CECILIE; LOPES PINTO, CLOVIS ANTONIO; et al. Loss of DNA methylation is related to increased expression of miR-21 and miR-146b in papillary thyroid carcinoma. CLINICAL EPIGENETICS, v. 10, NOV 20 2018. (15/17707-5, 15/20748-5)

BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; DOS REIS, MARIANA BISARRO; BELTRAMI, CAROLINE MORAES; HOMEM DE MELLO, JULIA BETTE; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; KUASNE, HELLEN; DRIGO, SANDRA APARECIDA; DE ANDRADE, VICTOR PIANA; SAIEG, MAURO AJAJ; LOPES PINTO, CLOVIS ANTONIO; et al. DNA Methylation-Based Method to Differentiate Malignant from Benign Thyroid Lesions. THYROID, v. 29, n. 9, AUG 2019. (15/20748-5, 15/17707-5)

BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; PEWARCHU, MICHELLE; MINATEL, BRENDA DE CARVALHO; SAGE, ADAM P.; MARSHALL, ERIN A.; MARTINEZ, VICTOR D.; ROCK, LEIGHA D.; MACAULAY, GAVIN; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ROGATTO, SILVIA REGINA; et al. Previously undescribed thyroid-specific miRNA sequences in papillary thyroid carcinoma. JOURNAL OF HUMAN GENETICS, v. 64, n. 5, p. 505-508, MAY 2019. (18/06138-8, 15/17707-5, 15/20748-5)

BELTRAMI, CAROLINE MORAES; DOS REIS, MARIANA BISARRO; BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; KUASNE, HELLEN; LOPES PINTO, CLOVIS ANTONIO; AMBATIPUDI, SRIKANT; HERCEG, ZDENKO; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ROGATTO, SILVIA REGINA. Integrated data analysis reveals potential drivers and pathways disrupted by DNA methylation in papillary thyroid carcinomas. CLINICAL EPIGENETICS, v. 9, MAY 2 2017. (08/57887-9, 15/20748-5)

BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; MENEZES DE LIMA, LARISSA BARRETO; DOS REIS, MARIANA BISARRO; HOMEM DE MELLO, JULIA BETTE; BELTRAMI, CAROLINE MORAES; LOPES PINTO, CLOVIS ANTONIO; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ROGATTO, SILVIA REGINA. PFKFB2 Promoter Hypomethylation as Recurrence Predictive Marker in Well-Differentiated Thyroid Carcinomas. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 20, n. 6, MAR 16 2019. (15/17707-5, 15/20748-5)

DOS REIS, MARIANA BISARRO; BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; BELTRAMI, CAROLINE MORAES; KUASNE, HELLEN; LOPES PINTO, CLOVIS ANTONIO; AMBATIPUDI, SRIKANT; HERCEG, ZDENKO; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ROGATTO, SILVIA REGINA. Prognostic Classifier Based on Genome-Wide DNA Methylation Profiling in Well-Differentiated Thyroid Tumors. JOURNAL OF CLINICAL ENDOCRINOLOGY & METABOLISM, v. 102, n. 11, p. 4089-4099, NOV 1 2017. (08/57887-9, 15/20748-5)

BARROS-FILHO, MATEUS C.; DE MELLO, JULIA B. H.; MARCHI, FABIO A.; PINTO, CLOVIS A. L.; DA SILVA, IGOR C.; DAMASCENO, PATRICIA K. F.; SOARES, MILENA B. P.; KOWALSKI, LUIZ P.; ROGATTO, SILVIA R.. GADD45B Transcript Is a Prognostic Marker in Papillary Thyroid Carcinoma Patients Treated With Total Thyroidectomy and Radioiodine Therapy. FRONTIERS IN ENDOCRINOLOGY, v. 11, APR 30 2020. (15/20748-5, 15/17707-5)

BELTRAMI, CAROLINE MORAES; DOS REIS, MARIANA BISARRO; BARROS-FILHO, MATEUS CAMARGO; MARCHI, FABIO ALBUQUERQUE; KUASNE, HELLEN; LOPES PINTO, CLOVIS ANTONIO; AMBATIPUDI, SRIKANT; HERCEG, ZDENKO; KOWALSKI, LUIZ PAULO; ROGATTO, SILVIA REGINA. Integrated data analysis reveals potential drivers and pathways disrupted by DNA methylation in papillary thyroid carcinomas. CLINICAL EPIGENETICS, v. 9, p. 11-pg., 2017-05-02. (08/57887-9, 15/20748-5)