Diagnóstico pré-cirúrgico de nódulos tireoidianos com base no perfil de metilação de DNA

• Processo: 21/09912-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas - PIPE
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2022
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2024
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Anatomia Patológica e Patologia Clínica
• Pesquisador responsável: Sandra Aparecida Drigo Linde
• Beneficiário: Sandra Aparecida Drigo Linde
• Empresa: Br4science Assessoria Técnica Científica Ltda
• CNAE: Atividades de serviços de complementação diagnóstica e terapêutica
• Município: Botucatu
• Pesquisadores principais: Carlos Eduardo Frigério Domingues ; Catherine Elisabeth Marie David
• Pesquisadores associados: Luiz Paulo Kowalski ; Silvia Regina Rogatto
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/08070-7 - Diagnóstico pré-cirúrgico de nódulos tireoidianos com base no perfil de metilação de DNA, BP.PIPE
• Assunto(s): Oncologia Neoplasias da glândula tireoide Diagnóstico Metilação de DNA Mutação Sequenciamento
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Câncer de tireoide | diagnóstico | metilação de DNA | mutação | nódulos tireoidianos | sequenciamento | Oncologia

Resumo

Nódulos tireoidianos são muito comuns na população e a maioria são benignos. O diagnóstico pela punção aspirativa por agulha fina (PAAF) é desafiador, especialmente no que se refere à distinção entre lesões malignas ou benignas de subtipos foliculares. Com o aumento nas indicações de PAAFs e da incidência mundial do câncer de tireoide, um grande número de pacientes ainda é submetido à cirurgia com objetivo diagnóstico, o que poderia ser evitado com o emprego de métodos diagnósticos com maior especificidade. Dessa forma, é de grande interesse o desenvolvimento de métodos moleculares diagnósticos de nódulos de tireoide. Em um estudo prévio de nosso grupo, identificamos potenciais marcadores de malignidade com base na análise de metilação de DNA usando a técnica de microarray. Um modelo preditivo combinando poucas CpGs foi elaborado e testado, demonstrando capacidade em diferenciar lesões malignas de benignas de tireoide. O objetivo dessa proposta é de promover a translação desse método para o cenário clínico real, e estabelecer um serviço diagnóstico de nódulos tireoidianos. Para tornar o teste mais prático, rápido e econômico, desenvolveremos um método baseado em sequenciamento direcionado pela tecnologia Oxford Nanopore. Esse método permitirá a análise direta do DNA (não modificado) das CpGs alvos em múltiplas amostras por corrida. Para otimizar ainda mais o desempenho classificador, incorporaremos a análise de mutações virtualmente exclusivas de lesões malignas de tireoide (genes BRAF e TERT). Durante a primeira fase da proposta, realizaremos estudos de corroboração técnica de nosso teste (ensaios de sensibilidade, especificidade e reprodutibilidade analítica) em amostras comerciais "padrão-ouro" (DNA 0 e 100% metilados, negativos e positivos para as mutações estudadas e de origem tireoidiana ou não-tireoidiana). Com isso, pretendemos demonstrar a viabilidade técnica do método (Fase I), para posterior análises de desempenho diagnóstico em amostras de PAAF (Fase II). Esperamos que os resultados obtidos supra as necessidades não atendidas no cenário atual, aonde a limitação diagnóstica de nódulos tireoidianos gera um grande impacto financeiro para o sistema de saúde e na qualidade de vida dos pacientes. Considerando o reduzido número de potenciais competidores no mercado nacional e internacional, nossa proposta tem um potencial elevado em aumentar o desenvolvimento e competitividade da nossa empresa. (AU)