Comparação entre o microbioma do trato respiratório de aves saudáveis e aves diagnosticadas com colibacilose

• Processo: 16/17421-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2017
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
• Pesquisador responsável: Renato Pariz Maluta
• Beneficiário: Renato Pariz Maluta
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Wanderley Dias da Silveira
• Bolsa(s) vinculada(s): 17/21904-6 - Comparação entre genomas de APEC e genomas de cepas comensais de Escherichia coli, BP.MS; 17/22288-7 - Comparação entre a microbioma intestinal de peixes sadios e peixes infectados experimentalmente com Streptococcus agalactiae, BP.MS; 17/15630-0 - Diagnóstico de colibacilose em aves, BP.IC; 17/12942-1 - Comparação entre o microbioma do trato respiratório de aves saudáveis e aves diagnosticadas com colibacilose, BP.JP
• Assunto(s): Metagenômica Epidemiologia molecular Escherichia coli Microbiologia Colibacilose animal
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Apec | Epidemiologia Molecular | Escherichia coli | metagenômica | Microbioma | Ngs | Microbiologia

Resumo

O trato respiratório é um reservatório para vários microrganismos. A presença de doenças nos pulmões altera as condições necessárias para o crescimento microbiano no trato respiratório. Portanto, doenças no trato respiratório podem alterar a composição da microbiota residente. A associação entre alterações na microbiota e doenças é conhecida. Em aves, por exemplo, a infecção pelo vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) facilita a colonização e produção de doenças por Escherichia coli (colibacilose). As linhagens de E. coli associadas à colibacilose são conhecidas como APEC (Avian Pathogenic E. coli). Embora existam trabalhos prévios relatando os constituintes da microbiota intestinal de aves, pouco se conhece a respeito da microbiota do trato respiratório. O presente trabalho tem como objetivo determinar a microbiota do trato respiratório de aves saudáveis e aves diagnosticadas com colibacilose. A microbiota será determinada usando sequenciamento de nova geração (NGS). As unidades taxonômicas operacionais (OTUs), presentes nas duas populações serão comparados. Dessa forma, os OTUs associados a cada população serão identificados. Adicionalmente, os genomas das linhagens APECs serão sequenciados e anotados. Este trabalho pode mostrar quais microrganismos estão associados ao microbioma do trato respiratório de aves saudáveis e aves com colibacilose. Outro aspecto do trabalho é o sequenciamento de genomas de APEC e comparação com genomas de E. coli comensais. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SILVA, BRUNA RAFAELA DOS SANTOS; DERAMI, MARIANA SILVEIRA; PAIXAO, DOUGLAS ALVAREDO; PERSINOTI, GABRIELA FELIX; DIAS DA SILVEIRA, WANDERLEY; MALUTA, RENATO PARIZ. Comparison between the intestinal microbiome of healthy fish and fish experimentally infected with Streptococcus agalactiae. AQUACULTURE RESEARCH, v. 51, n. 8, p. 3412-3420, AUG 2020. (16/17421-7, 17/22288-7)