EMU concedido no processo 15/06477-9: ultra-centrífuga e rotores

• Processo: 17/17706-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2017
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2024
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Carla Columbano de Oliveira
• Beneficiário: Carla Columbano de Oliveira
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 15/06477-9 - Estudo funcional de componentes do exossomo e do spliceossomo de Saccharomyces cerevisiae e de seu papel no controle pós-transcricional de expressão gênica, AP.TEM
• Assunto(s): Biogênese Expressão gênica Proteínas de ligação a RNA Processamento de RNA Equipamentos multiusuários
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biogênese de ribossomos | Controle pó-transcricional de expressão gênica | Interação proteína-proteína | interação proteína-RNA | processamento de RNA | splicing | Controle de expressão gênica
• Página web do EMU: Página do Equipamento Multiusuário não informada
• Tipo de equipamento: Processos Biológicos - Centrífugas - Ultracentrífugas
• Fabricante: Fabricante não informado
• Modelo: Modelo não informado

Resumo

O complexo enzimático com atividade exoribonucleolítica denominado exossomo tem sido o foco central da pesquisa do nosso grupo, tanto aquele presente em levedura, como em archaea. Temos realizado estudos funcionais do exossomo de levedura e estruturais do exossomo de levedura e de archaea (Lourenco et al., 2013; Luz et al., 2010; Navarro et al., 2008; Oliveira et al., 2002; Ramos et al., 2006). Neste projeto, propomos a continuação dos estudos do exossomo de levedura, focando principalmente na localização subcelular das subunidades deste complexo. Através de estudos anteriores em nosso laboratório, identificamos e caracterizamos as funções de várias novas proteínas de Saccharomyces cerevisiae envolvidas em diferentes etapas de processamento de RNA, dentre elas, Nop17 e Cwc24, que conectam splicing e processamento de pré-rRNAs (Gonzales et al., 2005; Goldfeder and Oliveira, 2008). Nop17 participa da montagem de complexos multiproteicos, dentre eles, um grupo específico de complexos de ribonucleoproteínas, os snoRNPs de box C/D (responsáveis por metilações de ribose nos rRNAs) (Gonzales et al., 2005). Através da 2 caracterização funcional de Cwc24, mostramos que esta participa de splicing, afetando principalmente pré-RNAs com a sequência de ramificação (branch site) não consenso (Goldfeder and Oliveira, 2008). Em um trabalho posterior, demonstramos que embora Cwc24 seja especialmente requerida no splicing de RNAs cujo intron não tem a sequência consenso no sítio de ramificação, Cwc24 participa do processo de splicing como um fator geral, através de suas interações com outros fatores de splicing, Brr2 e Prp19 (Coltri and Oliveira, 2012). Neste projeto, pretendemos continuar os estudos para a caracterização funcional de Cwc24 e determinar seu papel em splicing de pré-RNAs. Nop53 também foi identificada em nosso laboratório através de sua interação com Nop17 e caracterizada como sendo um fator envolvido em processamento de rRNA (Granato et al., 2005). Estudos posteriores demonstraram que Nop53 também interage com a subunidade do exossomo Rrp6, e ativa este complexo durante o processamento de rRNA (Granato et al., 2008). Neste projeto, pretendemos também continuar os estudos de caracterização funcional de Nop53 e determinar seu papel na ativação do exossomo. Este projeto, portanto, propõe o estudo de vários aspectos de processamento de RNA, que envolvem diferentes complexos enzimáticos, conectados entre si através de interações proteicas. (AU)