Identificacao in silico de potenciais sitios regulatorios em regioes nao-traduzidas nos genomas de leishmania spp.

• Processo: 06/01650-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Elton José Rosas de Vasconcelos
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Leishmania
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Leishmania Spp. | 5'- 3'-Utrs | Bioinformática

Resumo

Os protozoários Leishmania spp. são organismos unicelulares, pertencentes à ordem Kinetoplastida e à família Trypanosomatidae. São os agentes causadores de uma ampla gama de manifestações patológicas conhecidas como leishmanioses as quais variam desde lesões cutâneas auto-cicatrizantes a distúrbios viscerais que podem levar a morte. Com relação à pesquisa genômica de tripanossomatídeos, os avanços recentes têm revelado a importância da coordenação e análise da vasta informação acumulada com vistas à biologia dos organismos estudados. Particularmente com referência a Leishmania spp., estudos comparativos entre diferentes espécies, centrados na identificação in silico com posterior validação experimental dos padrões de conservação associados às regiões intergênicas (5’- e 3’-UTRs), podem ser as chaves computacionais para um entendimento biológico mais completo dos mecanismos de controle transcricional desses parasitas, que ainda permanecem não completamente elucidados. No presente projeto de mestrado, utilizaremos como modelo experimental in silico os genomas anotados de Leishmania braziliensis (versão 2.0), L. infantum (versão 2.0) e L. major (versão 5.2), disponibilizados pelo The Wellcome Trust Sanger Institute (http://www.sanger.ac.uk). O projeto estará inicialmente centrado na identificação e caracterização in silico de potenciais seqüências conservadas localizadas nas regiões não-traduzidas dos genomas das três espécies e posteriormente na validação experimental de alguns alvos identificados.