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Identificação de marcadores moleculares associados ao câncer de pâncreas utilizando microarrays de DNA

Processo: 07/50566-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de outubro de 2007
Vigência (Término): 31 de maio de 2012
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Eduardo Moraes Rego Reis
Beneficiário:Ana Carolina Tahira
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Marcador molecular   Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos   Expressão gênica   Adenocarcinoma   Transcriptoma   Pâncreas

Resumo

Neste projeto pretendemos comparar o perfil de expressão gênica de 45 amostras de adenocarcinoma de pâncreas, 20 amostras de pâncreas normal adjacente (margens tumorais) e 15 amostras de pancreatite crônica pela tecnologia de microarray de DNA. Um aspecto inovador do projeto é a utilização de um microarray customizado com cerca de 4 mil elementos, que além de conter sondas para éxons de genes reportados na literatura como relacionados ao câncer, contem também RNAs intrônicos e intergênicos sem potencial codificante para proteínas. Este microarray foi utilizado recentemente por nosso grupo para identificar, pela primeira vez na literatura, a existência de um conjunto de mensagens intrônicas antisenso com expressão correlacionada com o grau de diferenciação de tumores de próstata. Espera-se que a análise de um grande número de amostras clínicas de pâncreas utilizando este microarray, permita a identificação de mensagens intrônicas cujo nível de expressão esteja correlacionado à histologia e evolução clínica do câncer de pâncreas, contribuindo assim para a identificação de novos genes envolvidos no processo de carcinogênese, novos candidatos a marcadores moleculares de diagnóstico e prognóstico, assim como de possíveis alvos para terapia desta doença de elevada morbidade. (AU)