Genomica comparativa de enzimas de degradacao da parede celular vegetal em xanthomonas, xylella e stenotrophomonas.

• Processo: 08/51638-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2008
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Jonas Weissmann Gaiarsa
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 04/02851-9 - Elementos de transposição e seu impacto no genoma de bactérias e plantas, AP.TEM
• Assunto(s): Filogenia Fitopatologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Enzimas De Degradacao | Filogenia | Fitopatologia | Parece Celular Vegetal | Xanthomonadales

Resumo

Com o seqüenciamento dos genomas de diferentes espécies bacterianas fitopatogênicas, foram identificados possíveis genes codificantes para enzimas de degradação da parede celular vegetal. Com o intuito de esclarecer a função desses genes, estabelecer seu papel no processo de infecção da planta, além de melhorar o conhecimento sobre essa classe de enzimas, que têm importância econômica para a indústria, é feita a proposta desse projeto. O objetivo é estudar os genes que codificam para essa classe de enzimas encontradas nos genomas seqüenciados dos gêneros Xanthomonas, Xylella e Stenotrophomonas através de análises de genômica comparativa usando-se técnicas de bioinformática. Será feito um levantamento dos genes anotados nestes genomas como sendo codificantes para enzimas de degradação da parede celular vegetal e através de ferramentas de bioinformática serão feitas análises das seqüências nucieotídicas e de aminoácidos em questão. Serão estabelecidos grupos de genes ortologos nesses genomas por alinhamento e procura em bancos de dados (BLAST), além da comparação das seqüências por alinhamentos locais múltiplos e estabelecimento de uma filogenia através de diferentes técnicas moleculares filogenéticas. Candidatos de interesse serão eleitos para um posterior trabalho de caracterização molecular. Espera-se desta forma contribuir para um melhor entendimento da atividade dessas enzimas assim como o seu papel para a biologia desses organismos. (AU)