Caracterização molecular de micobactérias de crescimento rápido associadas ou não a surtos em cirurgias laparoscópicas para elaboração de teste de identificação rápida

• Processo: 08/01451-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2008
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Sylvia Luisa Pincherle Cardoso Leão
• Beneficiário: Cristianne Kayoko Matsumoto
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 06/01533-9 - Micobactérias de importância médica no Brasil: caracterização molecular, interação com o meio ambiente e com macrófagos, AP.TEM
• Assunto(s): Mycobacterium Diversidade genética Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: diagnóstico | Identificacao | Mycobacterium | Pfge | sequenciamento | surtos | micobacteriologia

Resumo

Surtos de infecções causadas por micobactérias não tuberculosas de crescimento rápido em cirurgias por via laparoscópica vêm ocorrendo desde 2004 em diferentes Estados (Pará, Goias, Rio de Janeiro, Espírito Santo, Rio Grande do Sul e Paraná). Pela técnica de identificação molecular denominada PCR-Restriction Enzyme Analysis (PRA-hsp65), os isolados dos diferentes Estados apresentaram um perfil comum a três espécies de micobactérias - Mycobacterium abscessus, Mycobacterium massiliense e Mycobacterium bolletii. A cepa responsável pelos surtos foi posteriormente identificada por sequenciamento de DNA como M. massiliense. Análises preliminares realizadas até o momento com isolados do Pará, Rio de Janeiro, Goias e Espírito Santo, usando a técnica de tipagem molecular Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE), mostraram que os pacientes foram infectados por uma única cepa de M. massiliense. Esta cepa só pode ser identificada no momento por sequenciamento de DNA e PFGE, ambos métodos caros e não amplamente disponíveis. Neste projeto serão estudadas 58 cepas isoladas do surto do Espírito Santo e 53 cepas apresentando o mesmo perfil de PRA-hsp65, mas não relacionadas a estes surtos, isoladas no mesmo período, em diferentes regiões do país. Será avaliada a diversidade genética desta(s) cepa(s) por sequenciamento de regiões conservadas do genoma de micobactérias. Pretendemos desenvolver um teste molecular rápido de identificação de cepas relacionadas a estes surtos, diferenciando-as das não relacionadas ao surto. Para isso, as sequências de DNA obtidas serão comparadas na busca de assinaturas genéticas que possibilitem a diferenciação entre isolados do surto e não relacionados. Como resultado, o teste molecular desenvolvido poderá ser implementado nos Lacens dos diferentes Estados para detecção de novos casos e vigilância epidemiológica. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MATSUMOTO, CRISTIANNE KAYOKO; CHIMARA, ERICA; RAMOS, JESUS PAIS; DIAS CAMPOS, CARLOS EDUARDO; DE SOUZA CALDAS, PAULO CESAR; BATISTA LIMA, KARLA VALERIA; LOPES, MARIA LUIZA; DUARTE, RAFAEL SILVA; LEAO, SYLVIA CARDOSO. Rapid tests for the detection of the Mycobacterium abscessus subsp bolletii strain responsible for an epidemic of surgical-site infections in Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 107, n. 8, p. 969+, DEC 2012. (08/01451-8)

CRISTIANNE KAYOKO MATSUMOTO; ERICA CHIMARA; JESUS PAIS RAMOS; CARLOS EDUARDO DIAS CAMPOS; PAULO CESAR DE SOUZA CALDAS; KARLA VALERIA BATISTA LIMA; MARIA LUIZA LOPES; RAFAEL SILVA DUARTE; SYLVIA CARDOSO LEÃO. Rapid tests for the detection of the Mycobacterium abscessus subsp. bolletii strain responsible for an epidemic of surgical-site infections in Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 107, n. 8, p. 969-977, 2012-12-00. (08/01451-8)

MATSUMOTO, CRISTIANNE KAYOKO; CHIMARA, ERICA; BOMBARDA, SIDNEY; DUARTE, RAFAEL SILVA; LEAO, SYLVIA CARDOSO. Diversity of Pulsed-Field Gel Electrophoresis Patterns of Mycobacterium abscessus Type 2 Clinical Isolates. Journal of Clinical Microbiology, v. 49, n. 1, p. 62-68, JAN 2011. (08/01451-8, 06/01533-9)