Mapeamento genético-funcional em cana-de-açúcar e localização de QTLs de importância econômica

• Processo: 10/50031-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2010
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: Anete Pereira de Souza
• Beneficiário: Estela Araujo Costa
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/52197-4 - Genomic-assisted breeding of sugarcane: using molecular markers for understanding the genetic architecture of quantitative traits and to implement marker assisted selection, AP.BIOEN.TEM
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Melhoramento genético vegetal Marcador molecular Etiquetas de sequências expressas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana-De-Acucar | Est-Ssrs | Mapeamento | Qtls | Spns

Resumo

Os programas de melhoramento genético podem ser acelerados com o desenvolvimento mapas genético-moleculares, com o mapeamento de marcadores moleculares fortemente ligados a genes que controlam as características de interesse. Adicionalmente, a utilização dos marcadores em estudos de mapeamento genético e de QTL's tem proporcionado um importante progresso no conhecimento da estrutura genética e genômica da cana-de-açúcar. Os ESTs (Expressed Sequence Tags) são utilizados no desenvolvimento de marcadores genético-moleculares funcionais, viabilizando a construção de mapas genéticos funcionais, os quais servem de base para a estratégia de genes candidatos. Tendo em vista os avanços que serão alcançados no melhoramento genético da cana-de-açúcar com a construção de um mapa genético-molecular funcional altamente saturado com marcadores funcionais obtidos a partir de ESTs de interesse, pretende-se: a) genotipar a população de mapeamento com marcadores moleculares do tipo EST-SSRs (EST-Simple Sequence Repeats) já desenvolvidos pelo grupo e também, SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) desenvolvidos a partir de genes e regiões de interesse. Os SNPs serão desenvolvidos a partir de sequências produzidas pelo projeto SUCEST, as quais são homólogas às proteínas de interesse; b) construir o mapa genético funcional para uma população obtida a partir de um cruzamento entre biparental entre variedades pré-comerciais do IAC, utilizando os marcadores funcionais desenvolvidos. A saturação do mapa complementará o programa de mapeamento genético em cana-de-açúcar que vem sendo desenvolvido pelo grupo desde 2002, bem como, permitirá o mapeamento de características quantitativas com muito maior precisão que a atualmente obtida. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

COSTA, E. A.; ANONI, C. O.; MANCINI, M. C.; SANTOS, F. R. C.; MARCONI, T. G.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PERECIN, D.; MOLLINARI, M.; XAVIER, M. A.; et al. QTL mapping including codominant SNP markers with ploidy level information in a sugarcane progeny. EUPHYTICA, v. 211, n. 1, p. 1-16, SEP 2016. (10/50031-1, 10/06715-3, 05/55258-6, 10/50549-0, 08/52197-4, 08/57908-6)

ALMEIDA BALSALOBRE, THIAGO WILLIAN; PEREIRA, GUILHERME DA SILVA; ALVES MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES; GAZAFFI, RODRIGO; BARRETO, FERNANDA ZATTI; ANONI, CARINA OLIVEIRA; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; COSTA, ESTELA ARAUJO; MANCINI, MELINA CRISTINA; HOFFMANN, HERMANN PAULO; et al. GBS-based single dosage markers for linkage and QTL mapping allow gene mining for yield-related traits in sugarcane. BMC Genomics, v. 18, JAN 11 2017. (12/25236-4, 12/11109-0, 08/52197-4, 10/50031-1, 10/50091-4, 08/57908-6, 10/50549-0)

AONO, ALEXANDRE HILD; COSTA, ESTELA ARAUJO; SILVA RODY, HUGO VIANNA; NAGAI, JAMES SHINITI; GONZAGA PIMENTA, RICARDO JOSE; MANCINI, MELINA CRISTINA; CAMILO DOS SANTOS, FERNANDA RAQUEL; PINTO, LUCIANA ROSSINI; DE ANDRADE LANDELL, MARCOS GUIMARAES; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; et al. Machine learning approaches reveal genomic regions associated with sugarcane brown rust resistance. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, NOV 18 2020. (10/50031-1, 18/18588-8, 05/55258-6, 14/11482-9, 08/52197-4, 19/03232-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

COSTA, Estela Araujo. Construção de um mapa funcional em cana-de-açúcar e mapeamento de QTLs de importância econômica. 2015. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.