Estudo estrutural das enzimas topoisomerase ii mitocondrial e old yel low enzyme de trypanosoma cruzi

• Processo: 10/50058-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2010
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Glaucius Oliva
• Beneficiário: Nathalia de Campos Rodrigues
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/57910-0 - Instituto Nacional de Biotecnologia Estrutural e Química Medicinal em Doenças Infecciosas - INBEQMeDI, AP.TEM
• Assunto(s): Cristalografia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biofisica Molecular | Cristalografia | Espectroscopia De Biomolecular | Topoisomerase

Resumo

A doença de Chagas é uma importante doença parasitária resultante da infecção pelo protozoário parasito hemoflagelado Trypanosoma cruzi, tendo insetos triatomíneos como vetores. A proposta deste projeto é o estudo estrutural da Topoisomerase II Mitocondrial de T. cruzi (TcTopollmit), utilizando para isso a proteína integral e seus domínios estruturais. DNA topoisomerases são enzimas que utilizam as atividades de excisão, manipulação e rearranjo da fita de DNA para modular diretamente a topologia do material genético. Estas enzimas estão envolvidas nos processos de replicação, transcrição, recombinação e remodelagem da cromatina. As topoisomerases do tipo II (topo II) são essenciais para os tripanosomatídeos, pois além de resolverem os problemas topológicos inerentes ao metabolismo do DNA nuclear, participam do processo de replicação do DNA do cinetoplasto, também denominado kDNA; este pode representar de 20 à 25% do conteúdo total de DNA destes organismos.Uma grande variedade de topoisomerases alvos de drogas tem sido identificada, muitas destas drogas geram lesões citotóxicas por complexarem a enzima de forma covalente ao DNA. A elucidação da estrutura tridimensional de topoisomerases (e seus domínios estruturais) de T. cruzi visa contribuir para a elucidação dos intrincados processos biológicos que ocorrem no cinetoplasto e para o estabelecimento de novas drogas no combate à doença de Chagas. Neste projeto o estudo estrutural será realizado através de diversas técnicas como espectroscopia de dicroísmo circular e fluorescência; SAXS, DLS e cristalografia de raios X. Especificidade nos sítios de clivagem desta enzima também será analisada através de experimentos de gel shift para identificar possíveis seqüências específicas de DNA que se ligam à Tctopollmit, seguidos de experimentos de co-cristalização para analisar os determinantes estruturais da ligação proteína-DNA, e que formarão a base experimental para o planejamento de análogos que inibam esta ligação. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

RODRIGUES, Nathalia de Campos. Estudo estrutural das enzimas Topoisomerase II Mitocondrial e Old Yellow Enzyme de Trypanosoma cruzi. 2014. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC/BT) São Carlos.