Estratégias para aumento de eficiência da seleção genômica em programas de melhoramento genético animal

• Processo: 10/06185-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2010
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Sandra Aidar de Queiroz
• Beneficiário: Haroldo Henrique de Rezende Neves
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Assunto(s): Desequilíbrio de ligação Endogamia Polimorfismo de um único nucleotídeo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Desequilíbrio de Ligação | endogamia | polimorfismos de nucleotídeo único | Redução de dimensionalidade | Simulação | Métodos de avaliação e seleção dos animais domésticos

Resumo

Três estudos serão desenvolvidos com o objetivo de investigar alternativas para aumentar a eficiência da seleção genômica em programas de melhoramento genético animal. Um primeiro estudo, fazendo uso de simulação de dados, será conduzido para verificar a viabilidade do emprego de técnicas de redução de dimensionalidade para predição do mérito genético com base em informação de painéis densos de marcadores moleculares, como uma alternativa de menor demanda computacional e que permitiria reduzir custos de genotipagem dos animais. Diferentes cenários serão simulados a fim de verificar o efeito de distribuição dos QTL e densidade dos marcadores sobre a acurácia dos métodos de predição estudados. O segundo estudo será desenvolvido a fim de comparar a habilidade preditiva dos métodos investigados no primeiro estudo utilizando dados de três características com herdabilidades de diferente magnitude provenientes de uma população real de camundongos. Por último, um estudo será conduzido com objetivo de verificar a influência da seleção genômica sobre a taxa de endogamia numa população simulada, comparando esta estratégia com a seleção convencional (por meio de BLUP) em termos de ganho genético e incidência de endogamia em longo prazo. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE REZENDE NEVES, HAROLDO HENRIQUE; CARVALHEIRO, ROBERTO; DE QUEIROZ, SANDRA AIDAR. Trait-specific long-term consequences of genomic selection in beef cattle. Genetica, v. 146, n. 1, p. 85-99, FEB 2018. (10/06185-4)

DE REZENDE NEVES, HAROLDO HENRIQUE; DOS REIS, FELIPE POLIN; PATERNO, FLAVIA MOTTA; GUARINI, ALINE ROCHA; CARVALHEIRO, ROBERTO; DA SILVA, LILIAN REGINA; DE OLIVEIRA, JOAO ADEMIR; DE QUEIROZ, SANDRA AIDAR. Herd-of-origin effect on the post-weaning performance of centrally tested Nellore beef cattle. TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION, v. 46, n. 7, p. 1235-1241, OCT 2014. (10/06185-4, 11/16066-5)

NEVES, HAROLDO H. R.; CARVALHEIRO, ROBERTO; PEREZ O'BRIEN, ANA M.; UTSUNOMIYA, YURI T.; DO CARMO, ADRIANA S.; SCHENKEL, FLAVIO S.; SOELKNER, JOHANN; MCEWAN, JOHN C.; VAN TASSELL, CURTIS P.; COLE, JOHN B.; et al. Accuracy of genomic predictions in Bos indicus (Nellore) cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 46, FEB 27 2014. (10/52030-2, 11/16643-2, 10/06185-4)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

NEVES, Haroldo Henrique de Rezende. Strategies to improve the efficiency of genomic selection in animal breeding programs. 2013. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal Jaboticabal.