História evolutiva e caracterização molecular de depolimerases ligno-celulósicas de Xanthomonas oryzae

• Processo: 10/50735-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Jonas Weissmann Gaiarsa
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Fitopatologia Arroz Xanthomonas Parede celular Genes Interações hospedeiro-patógeno Interferência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Carbohidrazes | Degradacao | Fitopatologia | Parede Celular | Xanthomonas

Resumo

O gênero Xanthomonas possui um dos maiores números de carbohidrazes dentre os fitopatógenos bacterianos conhecidos (Gaiarsa, Souza, Van Sluys, em preparação). Apesar disso, pouco se esclareceu sobre o papel dessas enzimas em processes de degradação da parede celular vegetal, desde o início do grande a porte de sequência genômicas de diversas espécies do mesmo grupo. Enzimas de depolimerização, que agem sobre polissacarídeos ainda complexos em estrutura, são de grande interesse em aplicações biotecnológicas, pois são parte limitante em processos industriais como sacarificação de biomassa. A proposta desse projeto feita como objetivo de esclarecer a função dos genes na biologia da interação entre patógeno e hospedeiro. O ponto de partida será uma lista de genes candidatos eleitos durante a etapa inicial do mestrado e a passagem para o doutorado direto permitirá o desenvolvimento de uma analise molecular de parte desses genes. Esses genes serão clonados em sistema de expressão ectópica para verificação de atividade por substratos corados em placa de cultura e ação sobre material vegetal. De acordo com a atividade serão desenhadas moléculas para um ensaio de interferência por RNA que será realizado em cultura do patógeno. Os alvos desse ensaio serão não só genes da triagem, mas também relacionados a elementos transponíveis do tipo IS, que possam ser implicados em regulação gênica por se localizarem em ilhas genômicas identificadas pelo grupo que contém os genes de interesse. As células submetidas a esse processo serão usadas para um teste e verificação de fenótipo de infecção em plantas de arroz. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

GAIARSA, Jonas Weissmann. História evolutiva de carbo-hidrolases ligno-celulósicas da família Xanthomonadaceae.. 2013. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.