Análise genômica comparativa entre isolados de Xylella fastidiosa associados à CLS

• Processo: 09/09651-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Regina Lucia Batista da Costa de Oliveira
• Beneficiário: Cristiane Aparecida Oliveira de Santana
• Instituição Sede: Pró-Reitoria de Pesquisa, Pós-Graduação e Extensão e Assuntos Comunitários. Universidade de Mogi das Cruzes (UMC). Mogi das Cruzes , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 09/50114-7 - Analise genomica comparativa de isolados de xylella fastidiosa obtidos de cafeeiros, AP.R
• Assunto(s): Xylella fastidiosa Biologia molecular Genômica comparativa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: CVC e CLS | genômica comparativa | Hibridação subtrativa supressiva | Xylella fastidiosa | Biologia Molecular

Resumo

Xylella fastidiosa (Xf) é um bacilo que se desenvolve no interior dos vasos xilemáticos de diversas espécies vegetais, associado ao desenvolvimento de patogenias em espécies de significativa importância econômica. Além da CVC, que acomete citros, outra fitopatogenia associada à Xf afeta um importante cultivar do agronegócio brasileiro: a Requeima Foliar do Cafeeiro (Coffee Leaf Scorch, ou CLS), cujos sintomas incluem seca de ramos, encurtamento de internódios, folhas cloróticas pequenas e deformadas, queima de bordos, abscisão foliar e rosetas agrupadas com frutos de menor tamanho. A doença foi descrita em 1997, em pomares dos estados de São Paulo e Minas Gerais e as relações evolutivas existentes entre os isolados de Xf obtidos de citros e café, associados à CVC e à CLS, são controversas: embora extremamente semelhantes, estudos evolutivos vêm resultando em filogenias que apresentam variações, dependendo do número de isolados testados e da metodologia utilizada. Estudos recentes sugerem que, embora representem grupos geneticamente distintos, os isolados de Xf associados à CVC e à CLS estão em constante recombinação, talvez representando um patossistema conjunto. Portanto, dada a coexistência de culturas de café e laranja no interior paulista, é possível que o pool gênico dos isolados de Xf-CLS sirva como um importante reservatório gênico potencial, podendo contribuir para a evolução dos isolados de Xf-CVC (e vice versa). O projeto aqui apresentado procurará ampliar nosso conhecimento sobre a estrutura genômica dos isolados de Xf obtidos de cafeeiros nos estados de São Paulo e Minas Gerais, representativos de diferentes grupos haplotípicos identificados nos pomares destas regiões. Utilizaremos uma abordagem já utilizada com sucesso para a avaliação genômica de isolados de citros, através de hibridações com microarranjos de DNA e de experimentos de hibridação subtrativa supressiva. As comparações serão conduzidas através de duas metodologias complementares: hibridação em microarranjos de DNA e a técnica de hibridação subtrativa supressiva (SSH).