Avaliação de polimorfismos de genes envolvidos no processo inflamatório induzido pela Helicobacter pylori na carcinogênese do estômago

• Processo: 10/17861-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Ana Elizabete Silva
• Beneficiário: Simone Berata
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 10/00507-0 - Avaliação de polimorfismos de genes envolvidos no processo inflamatório induzido pela Helicobacter pylori na carcinogênese do estômago, AP.R
• Assunto(s): Citocinas Neoplasias gástricas Polimorfismo genético Inflamação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer gástrico | citocinas | gastrite crônica | H | Inflamação | Polimorfismos Genéticos | pylori | Genética e Câncer

Resumo

1. Auxiliar na padronização das melhores condições da técnica de PCR/RFLP (Polymerase Chain Reaction/Restriction Fragment Length Polymorphism) dos diversos polimorfismos a serem investigados e atividades como extração de DNA, leitura da concentração de DNA/RNA, PCR/RFLP, eletroforese em gel de agarose2. Auxiliar na padronização e otimização das condições técnica de PCR em tempo real para avaliação da expressão relativa do RNAm dos genes IL-8, IL-10 e TNFa;3. Elaborar banco de dados dos sujeitos da pesquisa (grupos de câncer gástrico, gastrite crônica e controles), quanto aos os dados como idade, sexo, etnia, fatores de risco (etilismo, tabagismo, infecção pela H. pylori) e os resultados dos polimorfismos avaliados; 4. Auxiliar na análise estatística dos dados, como análise multivariada para verificação de associação entre os polimorfismos e fatores de risco e suscetibilidade ao câncer gástrico e gastrite crônica e avaliação das freqüências dos haplótipos pelo Programa Haploview (versão 4.1). 5. Atividades gerais no laboratório como cotação e compra de materiais, preparo de soluções, lavagem e esterilização de materiais, levantamento bibliográfico, etc, que serão desenvolvidas durante todo o desenvolvimento do projeto.Cronograma: 1º semestre: padronização das condições das técnicas de PCR-RFLP; início da elaboração de banco de dados e cadastramento dos sujeitos de pesquisa e dos resultados parciais; cotação e compra de materiais, levantamento bibliográfico2º e 3º semestres: finalização do cadastramento dos resultados no banco de dados; análises estatísticas dos dados; desenho dos primers e padronização/otimização das condições da técnica de PCR em tempo real para os genes IL-8, IL-10 e TNFa; cotação e compra de materiais, levantamento bibliográfico, análise dos resultados e elaboração do relatório final. JUSTIFICATIVA Considerando o grande número de amostras que serão genotipadas (cerca de 600) e o número elevado de polimorfismos que serão avaliados (19), serão gerados uma quantidade significante de dados que deverão ser devidamente cadastrados para exploração por análises estatísticas específicas. Também devido ao número elevado de polimorfismos que serão investigados serão necessárias a padronização e otimização das melhores condições para a PCR-RFLP e posteriormente para a avaliação de expressão gênica pela técnica de PCR em tempo real. O bolsista também ficará responsável pela cotação e pedido de compras dos materiais de consumo utilizados no projeto e deverá auxiliar em atividades gerais como preparo de soluções, lavagem e esterilização de materiais. Além do mais deve ser considerada a necessidade de formação e capacitação de recursos humanos para atuação profissional, assim contemplando a finalidade do Programa de Bolsas de Treinamento Técnico em treinar e aperfeiçoar alunos de nível superior. Portanto, a concessão da Bolsa TT-3, será importante tanto para o bolsista no desenvolvimento de habilidades e aprendizagem de novos conhecimentos como sua contribuição na execução do projeto.