Programação genética para geração de regras usadas na extração de interações entre proteínas em textos

• Processo: 11/07323-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2011
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Renato Tinós
• Beneficiário: Ana Livia Rodrigues Queiroz
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Computação evolutiva Inteligência artificial Algoritmos genéticos Mineração de texto Mapeamento de interação de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Algoritmos Geneticos | Bioinfomática | computação evolutiva | Mineração de Textos | Proteinas | Inteligência Artificial

Resumo

Como em outras áreas do conhecimento, pesquisadores na área de Biologia Molecular têm relatado suas descobertas principalmente através de artigos científicos. Como conseqüência, o número de artigos publicados que descrevem interações entre proteínas, e destas com genes, tem crescido exponencialmente nos últimos anos. Este projeto tem como principal objetivo investigar o uso de Programação Genética (PG), uma técnica de Computação Evolutiva usada para otimizar estruturas na forma simbólica, para extrair interações entre proteínas/genes a partir de bases de textos. Neste trabalho, a PG deve gerar novas regras sintáticas a serem utilizadas para indicar as interações entre proteínas em textos de uma base de dados. Desta forma, a PG permitirá alterar a forma das regras sintáticas através do processo de otimização. Cada indivíduo da PG codificará um conjunto de regras, que será avaliado em uma base de dados na qual a palavras e as interações das proteínas já encontram-se rotuladas. (AU)