Detecção e Análise de Sequências Afiliadas a Planctomycetes em Bibliotecas Metagenômicas de Manguezais do Estado de São Paulo

• Processo: 12/03953-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2012
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Fernando Dini Andreote
• Beneficiário: Juliana Eschholz de Araujo Ferreira
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Metagenômica Manguezais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bibliotecas metagenômicas | manguezais | Planctomycetes | Metagenômica

Resumo

Os manguezais são considerados um ecossistema único, devido sua particular combinação de condições ambientais, influenciados pela sua localização na interface entre o continente e oceano. O estudo deste ecossistema se torna urgente uma vez que os manguezais estão desaparecendo em todo mundo, e sua diversidade de grupos microbianos são ainda pouco conhecidas. Dentro dessa temática, o presente projeto visa descrever a possível funcionalidade de bactérias pertencentes ao filo Planctomycetes nos manguezais. Tais organismos são ainda pouco estudados, de difícil cultivo e apresentam crescimento lento e/ou dependente da interação com outros micro-organismos. Dentro desse filo são encontrados microrganismos pertencentes a gêneros descritos como capazes de fazer oxidação anaeróbica de amônio (anammox), que é uma importante transformação do nitrogênio em ambientes com baixa disponibilidade de oxigênio, como os manguezais. Estima-se que cerca de 50% da produção de N2 marinho seja formado a partir do processo anammox. Dentro deste contexto, a metagenômica permite a exploração do potencial biológico de maneira independente de cultivo, por meio da clonagem de grandes fragmentos de DNA obtidos de amostras ambientais. Neste projeto, o foco será a detecção e caracterização de sequências destes organismos em clones que compõem bibliotecas metagenômicas já construídas, a partir de amostras de sedimento de manguezais do Estado de São Paulo. Espera-se com esta metodologia, detectar por meio de PCR específico sequências relacionadas ao grupo Planctomycetes em clones metagenômicos de manguezais, e descrever os genes encontrados em tais insertos, na tentativa de ligar a filogenia deste grupo a distintas funções que o mesmo pode ter na manutenção e funcionalidade deste ambiente.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

FERREIRA, Juliana Eschholz de Araujo. Detecção e análise de sequências afiliadas à Planctomycetes em manguezais do estado de São Paulo. 2014. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.