Desenvolvimento de bancos de dados e ferramentas de genômica comparativa

• Processo: 12/06724-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2012
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Carlos Frederico Martins Menck
• Beneficiário: Huma Asif
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 09/52417-7 - Respostas celulares a lesões no genoma, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Caulobacter crescentus Filogenia Banco de dados Transferência genética horizontal
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | Caulobacter crescentus | Evolução | Filogenia | genômica comparative | transferência genética horizontal | Bioinformática

Resumo

Esta proposta prevê o desenvolvimento de uma melhoria na estrutura de bioinformática deste laboratório, com criação de bancos de dados e ferramentas de análise desses dados. Por um lado, pretendemos que seja desenvolvido um banco de dados que centralize e facilite a gestão das informações obtidas na análise de mutantes da bactéria Caulobacter crescentus. Por outro, pretendemos criar uma ferramenta amigável de genômica comparativa que permita a busca de genes comuns ou ausentes em genomas de determinados grupos bacterianos. (AU)