Análise Bioinformática do Genoma de Photorabdus luminescens MN7

• Processo: 12/20945-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2012
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Carlos Eduardo Winter
• Beneficiário: João Marcelo Pereira Alves
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 10/51973-0 - Nematóides e bactérias - abordagem genômica a um modelo experimental de interação parasita-hospedeiro, AP.R
• Assunto(s): Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anotação de Genoma | bioinformática | Photorhabdus luminescens | Biologia Molecular de Bactérias

Resumo

A construção de um esqueleto ("scaffold") do genoma de Photorhabdus sp. MN7, através de "next-generation sequencing" (NGS) é o principal objetivo do projeto apoiado pela FAPESP (proc. 10/51973-0) desenvolvido no Laboratório de Biologia Molecular de Nematoides. O presente projeto tem por finalidade desenvolver as ferramentas que permitirão fazer um inventário, o mais completo possível, dos genes envolvidos na produção de metabólitos secundários e toxinas que medeiam as relações simbióticas com o nematoide e patogênicas com o inseto e outras espécies de nematoides.