Influência da dinâmica transcricional no dobramento da molécula de RNA

• Processo: 12/19377-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Ney Lemke
• Beneficiário: Pedro Rafael Costa
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Dobramento de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dinâmica transcricional | Dobramento de RNA | Simulação | Rna

Resumo

Os ácidos nucleicos são alvos de intensa pesquisa desde o final do século XIX. Em meados do século XX, o Dogma Central da Biologia Molecular apresentou um quadro de como ocorre a transferência de informação entre os biopolímeros presentes no espaço intracelular. Até o início desse século, a molécula de RNA (ácido ribonucleico) era conhecida apenas pelo seu papel no Dogma Central da Biologia Molecular. Nos últimos anos, estudos mostraram sua capacidade catalítica e reguladora da expressão gênica. O composto químico com o qual uma determinada molécula de RNA irá interagir está diretamente ligado à sua sequência e estrutura. Determinar a conformação dessa molécula no espaço é uma questão importante para a biologia molecular, pois apesar da evolução do sequenciamento, métodos de determinação de estrutura molecular continuam custosos, laboriosos e ainda restritos a pequenos biopolímeros. Ferramentas de bioinformática e de biologia computacional podem colaboram significantemente na compreensão desse fenômeno. Entretanto, as técnicas tradicionais realizam uma previsão "estática" da estrutura dos polímeros de RNA. Dando continuidade aos estudos desenvolvidos durante o mestrado do aluno, propomos a criação de um algoritmo para simulação do dobramento cotranscricional. Com isso, poderemos estudar como a cinética da transcrição poderá alterar a formação das estruturas da molécula de RNA. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

COSTA, Pedro Rafael. Influência da dinâmica transcricional no dobramento da molécula de RNA. 2016. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências. Botucatu Botucatu.