Organização genômica e análise da expressão do gene hnRNP Q-like (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q-like) retroinserido no cromossomo B de Astatotilapia latifasciata

• Processo: 13/06092-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2013
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: César Martins
• Beneficiário: Bianca de Oliveira Carmello
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Genomas Evolução animal Cromossomos B Cichlidae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cromossomo B | Evolução | Genoma | hnRNP Q | Retrogene | Genética Animal

Resumo

Cromossomos B, também conhecidos como supernumerários, são elementos dispensáveis presentes em muitos genomas de eucariotos, incluindo peixes representantes da família Cichlidae (Perciformes). Estudos nesta família trouxeram importantes descobertas em genética, especiação e evolução, fazendo dos ciclídeos um modelo clássico de rápida radiação adaptativa. Análises genômicas em larga escala, envolvendo sequenciamento por next generation, foram aplicadas no peixe ciclídeo Astatotilapia latifasciata portadora de 1-2 cromossomos B. Estas análises sugerem que os cromossomos B desta espécie possa ter surgido a partir de um pequeno fragmento cromossômico do genoma A, seguido pela invasão deste fragmento por uma grande diversidade de DNA repetidos e genes. Entre as sequências presentes no cromossomo B, destaca-se o gene hnRNP Q-like (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q-like) que apresenta características de retrogene e possui alto número de cópias no genoma B+. Diante disso, o presente trabalho tem como objetivos identificar os mecanismos envolvidos na retro-inserção do gene hnRNP Q e compreender a organização genômica desta sequência. Este estudo permitirá melhor conhecimento sobre a origem e evolução desse retrogene, assim como o melhor entendimento da origem e evolução dos cromossomos B nas espécies. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

CARMELLO, Bianca de Oliveira. Organização genômima e análise da expressão do gene hnRNP Q-like (Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A-like) retroinserido no cromossomo B de Astatotilapia latifasciata. 2015. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências. Botucatu Botucatu.