Análise computacional do transcriptoma diferencial dos diferentes estágios de desenvolvimento da Tuta absoluta

• Processo: 13/21067-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Pesquisador responsável: Antonio Vargas de Oliveira Figueira
• Beneficiário: Pedro Paulo Trevisan de Oliveira
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/12869-6 - RNAi para controle de Tuta absoluta em tomateiro, AP.R
• Assunto(s): Pragas de plantas Inativação gênica Transcriptoma Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Transcriptoma | Bioinformática

Resumo

Tecnologias de sequenciamento massivo paralelo têm sido amplamente utilizadas para a caracterização do padrão de expressão global (Transcriptoma) de diversos organismos. A caracterização do transcriptoma revela quais são os genes expressos no tipo celular, tecido e/ou estádio de desenvolvimento de interesse, permitindo inferência funcional sobre o papel destes genes em cada contexto celular. Neste projeto, o transcriptoma da praga do tomateiro Tuta absoluta está sendo caracterizado em diferentes estádios do desenvolvimento do inseto. Esta abordagem irá permitir identificar os genes altamente expressos, e, portanto potencialmente importantes, nos primeiros estádios larvais, estádio inicial de herbivoria desta praga. O bolsista TT selecionado para desenvolver este plano de trabalho será treinado em técnicas computacionais e estará envolvido na análise de bioinformática que permitirão a análise das sequências e a identificação de genes alvos para o silenciamento gênico da praga do tomateiro Tuta absoluta. Além disto, este candidato será treinado e ficará responsável pela anotação e disseminação (data mining) dos dados do transcriptoma diferencial deste inseto em bancos de dados locais e públicos (disponíveis on line). (AU)