Análise molecular em genótipos de cana-de-açúcar submetidos à prolongada limitação hídrica pela técnica de RNA-seq

• Processo: 13/22122-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2014
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Maria Inês Tiraboschi Ferro
• Beneficiário: Aline Andrucioli Belesini
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia molecular Análise molecular Cana-de-açúcar Estresse hídrico Análise de sequência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Estresse Hídrico | qRT-PCR | RNA-seq | Saccharum spp | Biologia Molecular

Resumo

No Brasil a cultura da cana-de-açúcar tem se expandido para regiões com prolongados períodos de deficiência hídrica, o que vem limitando a produção sucroenergética. A melhor forma de contornar esse problema é utilizar cultivares tolerantes a este estresse. A presente proposta foi elaborada com o objetivo de analisar a expressão gênica de plantas submetidas a longos períodos de diferentes limitações hídricas, com vistas a gerar novos conhecimentos e ferramentas para a seleção de cultivares de cana tolerantes ao déficit hídrico prolongado, promover o desenvolvimento e a competitividade da cultura, além de contribuir para a formação de recursos humanos especializados na área. Para atingir tal objetivo, duas cultivares contrastantes (tolerante e sensível) serão cultivadas em vasos de 50 dm3 em casa de vegetação e submetidas a três potenciais hídricos do solo (ensaio com 6 tratamentos e 3 repetições) e serão avaliadas aos 30, 60 e 90 dias após aplicação dos tratamentos. O RNA total das folhas das plantas será extraído e os genes expressos (mRNAs) serão sequenciados pela técnica de RNA-Seq utilizando a plataforma HiScanSQ System (Illumina). Após o sequenciamento, os dados serão analisados de acordo com o pipeline de análise de RNA-Seq para a identificação dos genes diferencialmente expressos pelo cultivar tolerante em relação ao cultivar sensível ao estresse hídrico. Para a validação dos resultados será realizado a técnica de PCR quantitativa em tempo real (qRT-PCR). (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BELESINI, A. A.; CARVALHO, F. M. S.; TELLES, B. R.; DE CASTRO, G. M.; GIACHETTO, P. F.; VANTINI, J. S.; CARLIN, S. D.; CAZETTA, J. O.; PINHEIRO, D. G.; FERRO, M. I. T.. De novo transcriptome assembly of sugarcane leaves submitted to prolonged water-deficit stress. Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 2, MAY 26 2017. (13/22122-0, 13/11617-9)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

BELESINI, Aline Andrucioli. Análise do transcriptoma de folhas de cana-de-açúcar submetidas à prolongada limitação hídrica usando RNA-Seq. 2015. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal Jaboticabal.