| Processo: | 15/01764-0 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de junho de 2015 |
| Data de Término da vigência: | 31 de maio de 2016 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal |
| Pesquisador responsável: | Glaucia Mendes Souza |
| Beneficiário: | Danielle Izilda Rodrigues da Silva |
| Supervisor: | Erich Grotewold |
| Instituição Sede: | Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Ohio State University, Columbus, Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 13/13659-0 - Identificação de redes de genes e genoma ativo de cana-de-açúcar associados à seca, BP.DR |
| Assunto(s): | Cana-de-açúcar Secas Transcriptoma Expressão gênica Regulação da expressão gênica |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | ChIP-seq | drought | RNA Polymerase II | sugarcane | Biologia Molecular de Plantas |
Resumo A cana-de-açúcar é uma cultura economicamente importante no Brasil, e para atingir a atual demanda em açúcar e etanol o Brasil deve expandir a área plantada. No entanto, áreas de plantio adequadas são cada vez mais escassas, o que leva à necessidade de utilizar ambientes adversos, submetendo, dessa forma, as plantas às severas condições abióticas. Consequentemente, é essencial desenvolver plantas que apresentem maior tolerância a estresses, em especial a seca. O projeto SUCEST, combinado com o sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar, começou a sedimentar o caminho para os futuros estudos biotecnológicos. Agora é necessário elucidar a relação existente entre expressão e regulação gênica e características agronômicas de interesse com o objetivo de melhorar a tolerância à seca por meio de técnicas moleculares. A técnica de ChIP-Seq tem sido aplicada no estudo de interações in vivo entre DNA e proteínas e fornece uma ferramenta poderosa para elucidar a arquitetura de redes transcricionais. Apesar disso, poucos dados relacionados à sua aplicação em cana-de-açúcar estão publicamente disponíveis. A ausência do genoma completamente sequenciado da cana torna a sua aplicação ainda mais desafiadora. No entanto, em colaboração com vários grupos, o primeiro rascunho do genoma da cana está sendo obtido e será usado para as análises de ChIP-Seq. O estudo dos locais do genoma que são alvos da RNA Polimerase II (RNPII) é importante uma vez que permite a identificação de promotores ativos expressos sob diferentes condições e constitui uma abordagem interessante para estudar a regulação transcricional de genes relacionados à seca. O objetivo desse projeto é definir um conjunto de sequencias genômicas ligadas à RNPII, entender seu mecanismo de ligação e identificar promotores e genes que são ativados sob as condições de seca. A longo prazo, este projeto objetiva gerar ferramentas que irão permitir à comunidade científica associar motivos regulatórios com características como a seca. (AU) | |
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