| Processo: | 15/09436-1 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de agosto de 2015 |
| Data de Término da vigência: | 31 de outubro de 2015 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo |
| Pesquisador responsável: | Tsai Siu Mui |
| Beneficiário: | Acacio Aparecido Navarrete |
| Supervisor: | Jizhong Zhou |
| Instituição Sede: | Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | University of Oklahoma (OU), Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 12/13321-7 - Bio-indicadores microbianos taxonômicos e funcionais em solos sob sistemas de produção de cana-de-açúcar, BP.PD |
| Assunto(s): | Biologia computacional Indicadores biológicos Cana-de-açúcar Zinco |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | bioindicators | bioinformatics | functional genes | GeoChip array | sugarcane | zinc | Microbiologia e Bioquímica do Solo |
Resumo Apresentamos aqui uma proposta de estágio de pesquisa no exterior que visa atender um dos dois objetivos contidos no projeto de pesquisa principal 'Bioindicadores microbianos taxonômicos e funcionais em solos sob sistemas de produção de cana-de-açúcar' (FAPESP 2012/13321-7) em desenvolvimento. O principal objetivo deste estágio de pesquisa no exterior é a utilização de um microarranjo de genes funcionais microbianos, denominado GeoChip v. 5.0, a fim de identificar genes que possuem potencial para uso como bioindicadores de perturbação em solos de textura arenosa e baixa fertilidade natural cultivados com cana-de-açúcar sob aplicações de zinco. Esta proposta de trabalho tem como base resultados recentes obtidos no âmbito de estudos financiados pela FAPESP, tais como: (1) correlações do teor de zinco no solo e genes funcionais microbianos envolvidos na ciclagem do carbono e nitrogênio em solos cultivados com cana-de-açúcar (FAPESP 2012/13321-7*), e (2) resultados obtidos a partir de uma série de experimentos com micronutrientes no solo conduzida pelo Instituto Agronômico de Campinas (IAC), os quais tem mostrado significantes ganhos na produtividade canavieira com a aplicação de zinco (FAPESP 2011/07459-3**). Com base nesses resultados prévios, identificou-se a necessidade de estudar as respostas do microbioma do solo à aplicação de zinco em solos cultivados com cana-de-açúcar a fim de compreender em mais detalhes os seus efeitos sobre processos mediados por micro-organismos na interface solo-planta. Com isso, esta proposta objetiva definir genes funcionais microbianos que possuem potencial para uso como bioindicadores de perturbação em solos cultivados com cana-de-açúcar sob aplicações de zinco. Para atender a este objetivo, o DNA genômico do solo foi isolado de amostras coletadas em duas áreas experimentais cultivadas com cana-de-açúcar sob aplicação de diferentes doses de zinco no solo, as quais foram estabelecidas no âmbito do projeto FAPESP 2011/07459-3. As áreas experimentais localizam-se nas duas regiões de maior produção canavieira no estado de São Paulo: municípios de Serra Azul e Assis. O plano de trabalho contemplado nesta proposta é composto por três atividades principais: (i) detectar e quantificar genes associados à ciclagem do carbono, nitrogênio, fósforo e enxofre, metabolismo secundário, respostas à estresse e virulência, e analisar a derivação taxonômica desses genes com base na hibridização de amostras de DNA isoladas de solos experimentais cultivados com cana-de-açúcar utilizando a plataforma GeoChip v. 5.0, (ii) correlacionar a abundância desses genes em solos sob diferentes doses de zinco com a taxa de assimilação do CO2 fotossintético, condutância estomática e taxa de transpiração em plantas de cana-de-açúcar, e (iii) aplicar métodos computacionais e estatísticos para análise dos dados obtidos com GeoChip e medições de fatores fisiológicos a fim de identificar os principais genes funcionais microbianos que possuem potencial para uso como bioindicadores de perturbação em solos cultivados com cana-de-açúcar sob aplicações de zinco. (AU) | |
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