Analise dos genomas de Astyanax paranae (Characiformes, Characidae) portadores de 0 e 2 cromossomos B por Sequenciamento de Nova Geração.

• Processo: 15/14789-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2015
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Fausto Foresti
• Beneficiário: Duílio Mazzoni Zerbinato de Andrade Silva
• Supervisor: Juan Pedro M. Camacho
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universidad de Granada (UGR), Espanha
• Vinculado à bolsa: 13/24367-0 - ANÁLISE FUNCIONAL E EVOLUTIVA DO CROMOSSOMO B EM Astyanax paranae (CHARACIFORMES, CHARACIDAE, BP.DR
• Assunto(s): Genômica Evolução Sequenciamento de nova geração Astyanax
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Astyanax | B chromosomes | evolution | Genomic | Next Generation Sequencing | Repetitive DNA | Genômica

Resumo

Muito recentemente o poder de sequenciamento de última geração (NGS) começou a ser aplicado à investigação sobre cromossomos supranumerários (B) de diferentes organismos. No entanto, esta tecnologia ainda não foi aplicada aos cromossomas B em espécies de peixes. Resultados obtidos no Laboratório de Biologia e Genética Peixe (IB/Unesp/Botucatu) mostram que na população de Astyanax paranae do rio Capivara, um componente da bacia do Rio Tietê, um grande cromossomo metacêntrico B pode ser encontrado, e sítios de sequências de DNAr 18S e histona H1 foram identificados neste cromossomo em particular usando a técnica de FISH. Sabe-se que os cromossomos B são geralmente pobres em sequências de genes ativos. Considera-se, portanto, a possibilidade de que a presença de DNA ribossomal e histona H1 possa estar ligada à origem dos cromossomos supranumerários nesta espécie. A identificação de uma disposição simétrica destas sequências nos braços do cromossomo B reforça a hipótese de que a sua origem é provavelmente devido à formação de um isocromossomo. Assim, o presente projeto envolve a investigação do conteúdo genômico total do cromossomo B nesta espécie, bem como a identificação de regiões potencialmente funcionais de genes de cópia única, DNA repetitivo e marcadores moleculares específicos através de sequenciamento de última geração, com o objetivo de estudar a sua origem, função e evolução quando comparado com os cromossomas do complemento A. Este projeto está inserido no programa geral de estudos de citogenética de peixes neotropicais em desenvolvimento no Laboratório de Genética e Biologia de Peixes (IB/Unesp/Botucatu), com o objetivo de melhor entender a estrutura dos cromossomos de células eucarióticas e, em particular, de peixe. As análises bioinformáticas serão realizadas no departamento de Genética da Universidade de Granada, sob a supervisão do Dr. Juan Pedro Martinez Camacho. Esse instituto tem cinco pesquisadores com alta capacidade de análise e montagem genômica.