Ferramentas de sequenciamento molecular em Staurozoa (Cnidaria)

• Processo: 15/19325-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Antonio Carlos Marques
• Beneficiário: Lucília Souza Miranda
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/50242-5 - Dimensões da vida marinha: padrões e processos de diversificação em cnidários planctônicos e bentônicos, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: GenBank | Sequenciamento de DNA | Staurozoa | Invertebrados marinhos (Cnidaria)

Resumo

Esta proposta visa a capacitação técnica em métodos de obtenção de sequências, e posterior edição e publicação para análises moleculares em Staurozoa. Em particular, o técnico preparará extrações de DNA a partir dos tecidos de diferentes espécies, realizará reações de amplificação e purificação, além da edição das sequências e posterior publicação na base de dados GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/). O técnico irá lidar com sequências de DNA geradas a partir de diferentes marcadores moleculares (os mitocondriais COI e 16S, e os nucleares ITS, 18S e 28S) de espécies já descritas na literatura porém sem sequências publicadas (ca. 24 espécies, de um total de 50 espécies válidas para Staurozoa), além de espécies novas (ca. 8 espécies). Nossa expectativa é disponibilizar ca. 130 sequências, mais que o dobro das 57 sequências atualmente disponíveis para Staurozoa (para ca. 9 espécies) no GenBank. Estas sequências são fundamentais para análises de evolução e diversificação do grupo, objetivos inseridos no projeto temático "Dimensões da vida marinha: padrões e processos de diversificação em cnidários planctônicos e bentônicos" (FAPESP 2011/50242-5).