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Caracterização do perfil transcricional na interação Moniliophthora perniciosa x Solanum lycopersicum

Processo: 16/10524-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Data de Início da vigência: 05 de setembro de 2016
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2016
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Antonio Vargas de Oliveira Figueira
Beneficiário:Juliana Leles Costa
Supervisor: Piotr Andrzej Mieczkowski
Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: University of North Carolina at Chapel Hill (UNC), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:13/04309-6 - Análise funcional de genes de sinalização e defesa do cacaueiro na interação Moniliophthora perniciosa x Solanum lycopersicum, BP.DR
Assunto(s):Análise de sequência de RNA   Expressão gênica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:RNA-seq | Expressão Gênica

Resumo

A vassoura-de-bruxa consiste em uma das principais doenças que acometem o cacaueiro (Theobroma cacao), sendo causada pelo basidiomiceto Moniliophthora perniciosa e caracterizada pelos sintomas de inchamento e indução de brotações laterais nos ramos infectados. A espécie Solanum lycopersicum, também hospedeiro do fungo M. perniciosa, apresenta uma cultivar miniatura 'Micro-Tom' ('MT'), a qual demonstrou ser um modelo genético adequado para o estudo da interação com esse patógeno, com sintomas característicos da doença. Sabe-se que o desenvolvimento dos sintomas da vassoura-de-bruxa estão relacionados à sinalização por hormônios vegetais, uma vez que o patógeno causa um desbalanço hormonal na região meristemática do hospedeiro. O modelo genético 'MT', por dispor de diversos mutantes e linhas transgênicas com alterações hormonais, representa um importante recurso para investigação do papel dos hormônios na patogênese. Também, as alterações fisiológicas típicas dos sintomas em cacaueiro podem ser melhor investigadas no sistema 'MT'. Desse modo, no presente projeto, plantas de 'MT', mutantes e transgênico com alterações na via biossintética/percepção dos hormônios auxina e citocinina serão inoculados com M. perniciosa para análise massal dos transcritos por meio do sequenciamento do RNA (RNA-seq) ao longo do tempo. Os resultados serão comparados a dados disponíveis do transcriptoma da interação M. perniciosa x T. cacao, conduzida no mesmo grupo.

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Publicações científicas
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
COSTA, JULIANA L.; PASCHOAL, DANIELE; DA SILVA, EDER M.; SILVA, JAMILLE S.; DO CARMO, RAFAEL M.; CARRERA, ESTHER; LOPEZ-DIAZ, ISABEL; ROSSI, MONICA L.; FRESCHI, LUCIANO; MIECZKOWSKI, PIOTR; et al. . NEW PHYTOLOGIST, v. 231, n. 1, p. 365-381, . (16/10524-5, 13/04309-6, 19/12188-0, 16/10498-4, 15/00060-9, 17/17000-4)
PASCHOAL, DANIELE; COSTA, JULIANA L.; DA SILVA, EDER M.; DA SILVA, FABIA B.; CAPELIN, DIOGO; OMETTO, VITOR; ARICETTI, JULIANA A.; CARVALHO, GABRIEL G.; PIMPINATO, RODRIGO F.; DE OLIVEIRA, RICARDO F.; et al. . Journal of Experimental Botany, v. 73, n. 11, p. 20-pg., . (13/04309-6, 17/17000-4, 16/10498-4, 16/10524-5, 18/18711-4)