Análise do metatranscriptoma de rizosfera de cana-de-açúcar submetida ao estresse hídrico

• Processo: 16/08994-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Renato Vicentini dos Santos
• Beneficiário: Victor Marques de Oliveira Gambarini
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Rizosfera Estresse hídrico Mudança climática Biologia computacional Regulação da expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | cana-de-açúcar | estresse | metatranscriptômica | rizosfera | Bioinformática

Resumo

Em vista das mudanças climáticas, estão previstas mudanças no regime pluviométrico de todo o globo, causando seca em determinadas regiões e aumento de chuvas em outras. Nesse sentido, plantas de grande interesse comercial como a cana-de-açúcar devem ser alvo de pesquisas em busca de maior produtividade e, essencialmente, de maiores condições de adaptação frente às futuras alterações do clima. É sabido que os microrganismos que se desenvolvem próximos à raiz das plantas, ou na chamada rizosfera, podem influenciar o crescimento e desenvolvimento destas através de uma variedade de mecanismos, como por exemplo a promoção da mobilização de nutrientes, aumento da absorção de minerais, estímulo ao crescimento vegetal e supressão de patógenos. Dessa forma, esse trabalho visa utilizar métodos de bioinformática para analisar os dados gerados no sequenciamento em larga escala do metatranscriptoma da rizosfera de cana-de-açúcar submetida ao estresse hídrico. Assim, será caracterizado o perfil taxonômico e funcional da microbiota ativa, além de estudar a expressão gênica diferencial induzida pelo estresse hídrico e, finalmente, analisar redes de regulação gênica criadas a partir dos dados obtidos. Este projeto se insere dentro do projeto FAPESP de Auxílio à Pesquisa denominado "Impacto da elevada concentração de CO2 e do estresse hídrico na microbiota associada à rizosfera de cana-de-açúcar" (processo FAPESP 15/00408-5) e pertencente ao Programa FAPESP de Pesquisa sobre Mudanças Climáticas Globais - PFPMCG. Espera-se, desta maneira, fornecer subsídios ao desenvolvimento da cultura de cana-de-açúcar e ferramentas importantes para a manipulação deste sistema biológico. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PEREIRA, LETICIA BIANCA; DE OLIVEIRA GAMBARINI, VICTOR MARQUES; DE MENEZES, ALEXANDRE BARRETTO; OTTOBONI, LAURA M. M.; VICENTINI, RENATO. Responses of the sugarcane rhizosphere microbiota to different levels of water stress. APPLIED SOIL ECOLOGY, v. 159, MAR 2021. (14/05929-0, 16/08994-3, 15/00408-5)

PEREIRA, LETICIA B.; DE OLIVEIRA GAMBARINI, VICTOR MARQUES; DE MENEZES, ALEXANDRE BARRETTO; OTTOBONI, LAURA M. M.; VICENTINI, RENATO. Influence of Sugarcane Variety on Rhizosphere Microbiota Under Irrigated and Water-Limiting Conditions. Current Microbiology, v. 79, n. 9, p. 10-pg., 2022-09-01. (14/05929-0, 15/00408-5, 16/08994-3)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

GAMBARINI, Victor Marques de Oliveira. Análise do metatranscriptoma de rizosfera de cana-de-açúcar submetida ao estresse hídrico. 2018. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.