Triagem por agrupamentos biossintéticos dos micro-organismos Streptomyces sp B1 e Streptomyces wadayamensis

• Processo: 16/19370-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2016
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
• Pesquisador responsável: Luciana Gonzaga de Oliveira
• Beneficiário: Fernanda Bacciotti
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/12727-5 - "Genome mining" em Streptomyces, AP.R
• Assunto(s): Streptomyces Mineração de genoma Policetídeos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: genome mining | peptídeos-não ribossomais | Policetídeos | Streptomyces | Biotecnologia, Biologia Molecular, Produtos Naturais

Resumo

A análise recente do genoma de diversas linhagens de Streptomyces revelou uma grande abundância de clusters de genes que codificam enzimas do metabolismo secundário. Esse conjunto de informações confere uma importante evidência de que a capacidade para a produção de metabólitos por Streptomyces e outras actinobactérias não é completamente acessada sob as condições de cultivo em laboratório. Como uma alternativa as metodologias de buscas tradicionais por novos metabólitos, a aplicação de ferramentas genômicas iniciadas principalmente neste século, tem possibilitado o e isolamento de novas moléculas, elucidação de vias biossintéticas, caracterização de inúmeras enzimas e suas funções e também a identificação de intermediários de biossíntese. As linhagens endofíticas de Streptomyces wadayamensis e Streptomyces sp. isoladas de Citrus ssp foram sequenciadas recentemente pelo nosso grupo de pesquisas utilizando tecnologia Illumina MiSeq. Foram encomendadas a eleboração da construção da biblioteca genômica em vetor do tipo ESAC (E. coli-Streptomyces Artificial Chromosome) com a empresa Bio S&T Inc., Montreal, Canadá, especializada e exclusiva na construção deste tipo de biblioteca utilizando linhagens de Streptomyces. Em princípio a empresa realizou a triagem de 5 agrupamentos de genes na biblioteca de Streptomyces sp B1. Como é interesse do grupo de pesquisas fazer uma ampla exploração dos agrupamentos de genes mapeados nas duas linhagens, pretendemos fazer o processo de triagem no Brasil de todos os agrupamentos de genes de interesse.