Desenvolvimento de protocolos de amplificação de locos microssatélites e genotipagem em equipamento automatizado adquirido para esta finalidade (fragment analyser)

• Processo: 16/22440-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2016
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: Carlos Augusto Colombo
• Beneficiário: Cicera Eduarda da Costa
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/23591-7 - Seleção de matrizes de macaúba para formação de jardim de sementes e produção de mudas comerciais visando ao biodiesel com preservação de variabilidade genética, AP.TEM
• Assunto(s): Variação genética em plantas Diversidade genética Melhoramento genético vegetal Marcador molecular Produção de mudas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Acrocomia aculeata | bioenergia | Diversidade Genética | marcadores moleculares | Oleo vegetal | Melhoramento genético

Resumo

O projeto irá envolver grande volume de atividades em biologia molecular para caracterização genética de genótipos procedentes de diversos países e regiões do Brasil onde ocorre naturalmente (do sul do México ao norte da Argentina). Além de bons atributos agronômicos, estamos propondo o plantio de mudas com ampla base genética como forma de mitigação de adversidades causadas por mudanças climáticas e ataques de pragas e doenças eventuais. A vulnerabilidade genética tem sido a responsável pelo surgimento de pragas e doenças ao longo do tempo do cultivo de várias espécies florestais, como citros, dendê, eucaliptos, pinus, dentre outras. Assim, a variabilidade genética da espécie e de populações naturais onde matrizes serão coletadas para estudos de avaliação de progênies será abordada tanto por microssatélites como por genotipagem por sequenciamento. Esta abordagem visa à produção de mudas comerciais para plantio em larga escala com preservação de variabilidade genética, formação de coleções núcleo de germoplasma, experimento de avaliação de progênies em vários ambientes e formação de jardim de sementes. As atividades de marcadores microssatélites envolvem muito tempo de dedicação em bancadas de laboratório. Para cada loco SSR será necessário realizar testes de amplificação (PCR) para determinação das melhores temperaturas de anealing e polimeração a fim de se evitar a amplificação de bandas espúrias (indesejáveis). Este procedimento será de grande importância, haja vista que o número de amostras do estudo é relativamente grande e que o produto desejado das amplificações (alelos) deverá ser visualizado em equipamento automatizado adquirido para esta finalidade (Fragment Analyser). Este equipamento é extremamente sensível e deverá ser operado apenas pelo técnico de nível médio que pretendemos incorporar ao projeto. (AU)