| Processo: | 17/01151-3 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 20 de abril de 2017 |
| Data de Término da vigência: | 31 de janeiro de 2018 |
| Área de conhecimento: | Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química |
| Pesquisador responsável: | Munir Salomao Skaf |
| Beneficiário: | Caroline Simões Pereira |
| Supervisor: | Gregg Beckham |
| Instituição Sede: | Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | National Renewable Energy Laboratory (NREL), Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 15/25031-1 - Dinâmica molecular de enzimas modificadores de de carbohidratos para desconstrução e valorização de biomassa lignocelulósica, BP.DR |
| Assunto(s): | Química teórica Química computacional Biomassa lignocelulósica Simulação de dinâmica molecular |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | carbohydrate degrading enzymes | enzymatic reactions | Lignocellulosic biomass | Mm | molecular dynamics | Qm | transglycosylation | Química Teórica Computacional |
Resumo A biomassa lignocelulósica é a maior fonte de biopolímeros na Terra e possui potencial incomparável para produção de biocombustíveis, materiais e produtos químicos. Esses biopolímeros exibem resistência contra degradação térmica, química e enzimática (recalcitrância), o que está relacionado à arquitetura molecular e à natureza química desses. Compreender o mecanismo de ação das enzimas ativas em biomassa é, portanto, essencial para controlar e possibilitar o aumento de atividade contra recalcitrância por meio de engenharia de enzimas. Enquanto o mecanismo catalítico de muitas enzimas são relativamente entendidos, um grupo particular de enzimas relacionadas evolutivamente, que incluem glicosídeo hidrolases da família 45, expansinas e transglicosilases líticas (TLs), que compartilham o mesmo sítio catalítico, faltanto o resíduo esperado para atuar como base e, portanto, pode seguir uma rota catalítica (desconhecida até o momento) diferente das outras enzimas. Nós propomos usar simulações computacionais com método TPS-QM/MM ( do inglês, transition path sampling quantum mechanics/molecular mechanics) para estudar o mecanismo catalítico de TLs. O resultado contribuirá no desenvolvimento de novas enzimas, e ajudará no entendimento do mecanismo de outras enzimas ativas em carbohidratos da mesma classe. O projeto será desenvolvido no National Renewable Energy Laboratory (NREL), que possui um grupo computacional com enorme experiência na elucidação de mecanimos de enzimas ativas em lignocelulose, assim como toda a expertise necessária para aplicar simulações de TPS para desvendar o mecanismo de TLs. Nosso grupo na Unicamp tem colaborado com o NREL e o desenvolvimento deste projeto reforçará ainda mais os esforços para a compreensão dos mecanismos das enzimas no âmbito do Center of Computational Engineering & Sciences (CEPID, Proc. 2013/08293-7). (AU) | |
| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa: | |
| Mais itensMenos itens | |
| TITULO | |
| Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ): | |
| Mais itensMenos itens | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |